2017-05-08
梨是我們日(ri)常(chang)生(sheng)活中最常(chang)見(jian)的(de)(de)水果之(zhi)一(yi)，而且(qie)廣(guang)(guang)泛(fan)分布世(shi)界(jie)各(ge)地。梨最早(zao)起源(yuan)于(yu)中國西部(bu)山區，而古羅馬(ma)人(ren)為(wei)梨的(de)(de)栽培與傳(chuan)播做出(chu)了重要貢(gong)獻(xian)。據報道，梨的(de)(de)栽培已有(you)2000~3000年的(de)(de)歷(li)史(shi)，公元前(qian)1世(shi)紀就有(you)40多(duo)種梨的(de)(de)栽培品種。目前(qian)在50多(duo)個國家都有(you)梨的(de)(de)栽種，幾乎(hu)遍(bian)布各(ge)個大陸。之(zhi)所以能有(you)如(ru)此廣(guang)(guang)泛(fan)的(de)(de)分布，在于(yu)能夠培育出(chu)適應各(ge)地不同環境的(de)(de)品種。盡管(guan)有(you)著(zhu)廣(guang)(guang)泛(fan)的(de)(de)地理分布，但并沒有(you)出(chu)現明(ming)顯的(de)(de)生(sheng)殖隔離，這(zhe)對新品種的(de)(de)繁育有(you)著(zhu)重要意義。
說(shuo)到遺傳(chuan)(chuan)育(yu)種(zhong)，就不(bu)得不(bu)提分(fen)子標記(ji)。分(fen)子標記(ji)在(zai)遺傳(chuan)(chuan)多樣性(xing)和遺傳(chuan)(chuan)關(guan)聯(lian)分(fen)析等(deng)研究領(ling)域(yu)有著重要應(ying)用。接下來小(xiao)編為(wei)大家介紹一篇(pian)利(li)用GBS（Genotyping-by-sequencing）技術對梨的遺傳(chuan)(chuan)多樣性(xing)及選(xuan)擇印記(ji)進行(xing)研究的報道。
材料和方(fang)法
研究者選用來自亞洲品種、歐洲品種以及兩者雜交品種的214個個體作為研究材料。并對其相關性狀（果實硬度、大小、酸度及變形等）進行調查。通過GBS的方法對樣本進行測序。以P. × bretschneideri (cultivar ‘Suli’) 和P. communis(cultivar ‘Bartlett’)為參考基因組，對不同樣本進行變異檢測。
結(jie)果與討論(lun)
1.從(cong)GBS數據中獲(huo)得15000個高質(zhi)量SNP 標記位點。其中歐洲種和亞洲種分(fen)別含有(you)25%和11%的獨有(you)等位基(ji)因。
2.通(tong)過NJ法構建(jian)無根進(jin)化樹，發現(xian)歐洲種(zhong)(zhong)和(he)亞(ya)洲種(zhong)(zhong)之間存在明顯的群體分(fen)離現(xian)象。
3.通(tong)過群體結(jie)構分(fen)析，發現種間(jian)雜交物種有55%的(de)遺傳物質來自亞洲祖先(xian)，45%的(de)遺傳物質來自歐洲祖先(xian)。
4.不同樣本間(jian)的(de)表型變異與(yu)遺傳分化有(you)著(zhu)顯著(zhu)的(de)關聯(lian)性(xing)。通(tong)過(guo)大(da)數據量的(de)選擇掃(sao)描(miao)分析(xi)確認了20多個(ge)離群SNP位(wei)點，這些(xie)位(wei)點可(ke)能是(shi)受到定向選擇或者跟選擇相關的(de)位(wei)點。
總結(jie)
本文對選擇區(qu)域查找(zhao)和基因型(xing)-表型(xing)聯合分析在生物(wu)適(shi)應和選擇印記(ji)研究中的(de)應用進(jin)行了初步探(tan)討。該研究對于歐洲和亞洲梨(li)的(de)獨立(li)進(jin)化的(de)理解以(yi)及對于梨(li)的(de)適(shi)應性研究有著重(zhong)要的(de)意義。
