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科研服務

病毒基因組測序

病毒(Virus)由一種核酸分子(DNARNA)與蛋白質(Protein)構成或由蛋白質構成(如 朊病毒)。根據遺傳物質的組成,可分為單鏈 DNA 病毒(ssDNA)、雙鏈 DNA  病毒(dsDNA)、單鏈 RNA 病毒(ssRNA)、雙鏈 RNA  病毒(dsRNA)和蛋白質病毒(如朊病毒)。根據宿主類型的不同,可以分為噬菌體(細菌病毒)、植物病毒(煙草花葉病毒)和動物病毒(如禽流感病毒、天花病毒和HIV等)。


病毒全基因組測序(Virus  Whole  Genome   SequencingVWGS),是指基于二代高通量測序技術,對病毒全基因組進行測序,利用生物信息分析手段,得到病毒的全基因組序列,解析編碼信息,并獲得相應的變異信息。



產品參數




產(chan) 品

文庫插入片段大小(bp)

測(ce)序平臺及(ji)測(ce)序模式

測序(xu)深度(du)

交付指標(biao)

項目周期

痕量(liang)單鏈RNA病毒測序 A

300 ~ 500

Illumina MiSeq,PE251

~100 ×

數據(ju)量(liang)

30 個自然日

痕量(liang)單鏈RNA病(bing)毒測(ce)序 B

300 ~ 500

Illumina HiSeq,PE150

~100 ×

數(shu)據量

40 個自(zi)然日

常(chang)規單鏈RNA病毒測序 A

300 ~ 500

Illumina MiSeq,PE251

~100 ×

數據量

30 個(ge)自然日(ri)

常規單鏈RNA病(bing)毒(du)測序(xu) B

300 ~ 500

Illumina HiSeq,PE150

~100 ×

數(shu)據(ju)量(liang)

40 個自然日

常(chang)規(gui)雙(shuang)鏈(lian)DNA病毒測序 A

300 ~ 500

Illumina MiSeq,PE251

~100 ×

數(shu)據量(liang)

30 個自然日

常規雙鏈(lian)DNA病毒測(ce)序 B

300 ~ 500

Illumina HiSeq,PE150

~100 ×

數據量(liang)

40 個(ge)自然日


* 測(ce)序(xu)深度(du):推薦的(de)測(ce)序(xu)深度(du)指目標病(bing)毒基因(yin)組的(de)測(ce)序(xu)深度(du),具體測(ce)序(xu)數據量計算(suan)(suan)參見“病(bing)毒基因(yin)組測(ce)序(xu)數據量估算(suan)(suan)”;

1 痕量病毒:指核酸量在10 ng~200 ng的病毒樣(yang)品


樣品要求



image.png


*病(bing)毒(du)(du)類(lei)樣本不接(jie)受(shou)原樣送(song)樣,只接(jie)收(shou)核算(suan)樣品,及DNA病(bing)毒(du)(du)僅接(jie)受(shou)提(ti)取好的(de)雙鏈DNA,RNA病(bing)毒(du)(du)僅接(jie)受(shou)反轉錄好的(de)雙鏈cDNA。