菌群(qun)組成譜全長(chang)測序研究
基于PacBio三(san)代測序平(ping)臺,能夠讀(du)取群落微生態系統中微生物的rRNA基因/ITS全(quan)長序列,不(bu)受(shou)制于短序列的局限性(xing),并(bing)確保全(quan)長序列的測序,從(cong)而在(zai)種(zhong)甚至菌(jun)株(zhu)等精細(xi)水平(ping),解析(xi)菌(jun)群多(duo)樣性(xing)和組(zu)成譜。
產品特色
l 深入獲取(qu)微(wei)(wei)生物群落的精(jing)細組成信息;
l 預(yu)測(ce)微生物群(qun)落的潛(qian)在代謝功能,并指導后續宏基(ji)因組測(ce)序研究;
l 通過(guo)“全微(wei)生物組(zu)關(guan)聯研究(Microbiome-Wide Association Studies,MWAS)”,鑒定與表型/組(zu)間(jian)差異相關(guan)的關(guan)鍵物種。
應用領域
l 微(wei)生(sheng)物組與環境互作關系的研究;
l 微(wei)(wei)生物組(zu)與宿主共(gong)生關系(xi)的(de)研究;
l 微生物(wu)組(zu)在臨(lin)床醫學和精(jing)準(zhun)醫療領域的應用(yong);
l 微生物組在發酵工藝、食品加工/檢測等行業的(de)應(ying)用。
派森諾優勢
l 自(zi)動化(hua)、完善的DNA提取擴(kuo)增體(ti)系和樣本前處理流程;
l 派(pai)森諾擁有PacBio RSII和Sequel兩種(zhong)單分子實時測序平臺,提供測序服務(wu);
l Greengenes/Silva/HOMD/RDP/Unite/MaarjAM等多個物(wu)種注(zhu)釋數據庫(ku),優化物(wu)種的分類鑒(jian)定;
l 專家(jia)教授多方位支(zhi)持,可按需個性(xing)化(hua)定制;
l 項目經驗豐富,涵蓋水樣、活性(xing)污泥、土壤、排(pai)泄(xie)物、體液、組織等各類(lei)樣本。
PacBio和Illumina平臺對(dui)菌群16S rRNA基因(yin)測序結果的(de)(de)比較,并改善(shan)物種分類(lei)信(xin)息(xi)的(de)(de)不確(que)定性。
派森諾菌(jun)群組成譜全長測序分(fen)析流程(cheng)