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科研服務

真菌基因組de novo測序


真菌全(quan)基(ji)因組從頭(tou)測序(Fungi Whole Genome de novo Sequencing),是指對基因(yin)(yin)組(zu)(zu)(zu)序列未知(zhi)或無近緣物種基因(yin)(yin)組(zu)(zu)(zu)信息的某個物種,構(gou)建不同插入片(pian)段的基因(yin)(yin)組(zu)(zu)(zu)DNA文庫(ku)(ku)并對文庫(ku)(ku)進行序(xu)列(lie)測定,然后利用生物信(xin)息(xi)學方法進行拼接(jie)、組裝(zhuang)和注(zhu)釋(shi),從而獲得該真菌的全基因組序(xu)列(lie)圖(tu)譜(pu)。



產品參數



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1、簡單(dan)真菌:35% ≤ G+C% ≤ 65% 且雜合(he)度 ≤ 0.5%且基因組(zu) ≤ 40 Mb; 

2、復雜真菌:G+C% > 65% 或 G+C% <35%或雜合度 > 0.5%或基因(yin)組 > 40 Mb; 

   Contig N50:將組裝得(de)到(dao)(dao)的(de) Contig  按序(xu)列(lie)長度(du)從長到(dao)(dao)短排序(xu)并(bing)依(yi)次累加,當(dang)累加長度(du)正(zheng)好到(dao)(dao)序(xu)列(lie)總長度(du)  50%  時,最后一(yi)條(tiao)序(xu)列(lie)的(de)長度(du)。


樣品要求



一、原樣類

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二、核酸類

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