CircRNA(Circular RNA),是一類不(bu)具有 5' 末端(duan)帽子(zi)和 3' 末端 poly(A)尾巴(ba)、并以共價鍵(jian)形成穩(wen)定閉合環狀結構的非編碼 RNA 分(fen)子。 CircRNA 廣泛(fan)存在于(yu)生(sheng)物細胞中,對 miRNA 起(qi)重(zhong)要的(de)調控(kong)作用(yong),進而調控(kong)基(ji)因表達。隨著高通量測序技(ji)術的(de)發(fa)展, CircRNA 在(zai)多種真核生物體內被大量鑒定出(chu)來,利用高通量測序技術,對(dui)生物樣本(ben)中的CircRNA 進行鑒定、表達豐度檢測及(ji)結構(gou)分(fen)析,是 RNA 領域的研究(jiu)熱(re)點,推動更(geng)深入的基(ji)因表達(da)研究(jiu)。
CircRNA 實驗(yan)設計(ji)思路為差異(yi)比(bi)較,常(chang)見的類型(xing)為實驗(yan)組與對照組(case VS control),進(jin)(jin)行兩兩比(bi)較(jiao)(jiao);若考慮時空因素(su),如按照不同(tong)生長發育階段或者(zhe)疾病發生發展整個過程進(jin)(jin)行比(bi)較(jiao)(jiao),即(ji)進(jin)(jin)行多重比(bi)較(jiao)(jiao)分析,然后對差異的(de)CircRNA 來源基因進行預測和富集分析。一組樣(yang)品建(jian)議至(zhi)少 6 個生物學(xue)重復。