真菌全(quan)基因組從頭測序(xu)(Fungi Whole Genome de novo Sequencing),是(shi)指(zhi)對基因(yin)組序列未(wei)知或無近緣物種(zhong)基因(yin)組信息(xi)的某個物種(zhong),構建不同插入片段(duan)的基因(yin)組DNA文庫并對(dui)文庫進行(xing)(xing)序列測定,然后(hou)利用生物(wu)信息學方(fang)法進行(xing)(xing)拼接、組裝(zhuang)和(he)注釋,從(cong)而獲(huo)得該真菌的全基因組序列圖(tu)譜。
產品參數
1、簡單真菌:35% ≤ G+C% ≤ 65% 且雜合(he)度 ≤ 0.5%且基因(yin)組 ≤ 40 Mb;
2、復雜(za)真菌:G+C% > 65% 或(huo) G+C% <35%或(huo)雜(za)合度 > 0.5%或(huo)基(ji)因組 > 40 Mb;
Contig N50:將組裝得到(dao)的 Contig 按序(xu)列長(chang)(chang)度(du)(du)從長(chang)(chang)到(dao)短(duan)排序(xu)并依次累加,當累加長(chang)(chang)度(du)(du)正好(hao)到(dao)序(xu)列總長(chang)(chang)度(du)(du) 50% 時(shi),最后一條序(xu)列的長(chang)(chang)度(du)(du)。
樣品要求
一、原樣類
二、核酸類