BSA(Bulked Segregant Analysis):稱為混合(he)分組分析法(fa),是(shi)一(yi)種利用(yong)極(ji)端性(xing)狀進行功能基因定位的(de)一(yi)種方法(fa)。主要是(shi)將兩組具有極(ji)端性(xing)狀的(de)群(qun)體(ti)進行混池測序,比較兩組群(qun)體(ti)在多態位點(SNP)的(de)等位基(ji)因頻率(AF)是(shi)否具有顯著差異,即而將目標(biao)性狀基因定位在染色體區段上(shang)。
自然突變基因定位:QTLseq
人工誘變基因定位:Mut Map
產品參數
研究類型 | 樣(yang)本(ben)選(xuan)取 | 測序平臺 | 測序深度 | 項(xiang)目(mu)周期(qi) |
QTL | 親本(ben):2個極(ji)端表型親本(ben) 子代:極端(duan)表型個(ge)體混池(chi), 每個(ge)池(chi)至少20個(ge)個(ge)體 | Illumina Novaseq PE400, 150*2 | 親本(ben) ~20× 子(zi)代混池(chi) ~30× | 35天 |
MutMap | 親(qin)本:1個(ge)野生(sheng)型表型親(qin)本子代(dai):極端表型個(ge)體混池(chi), 每個(ge)池(chi)至(zhi)少(shao)20個(ge)個(ge)體 | 親本 ~20× 子代混池 ~30× |