全基因組關聯分析（Genome-wide association study，GWAS）是一種在某一特定群體中研究遺傳突變和表型之間的相關性的方法。通過對遺傳多樣性豐富的自然群體中的個體進行測序，結合準確的目標性狀的表型數據及統計方法進行全基因組分子標記與性狀之間的關聯分析，可對動植物復雜性狀進行定位，快速獲得影響目標性狀表型變異的遺傳標記或候選基因。
產品(pin)參數
基于重測序 | 基(ji)于簡(jian)化測(ce)序 | |
測(ce)序(xu)平臺(tai) | Illumina Novaseq | |
打斷方式 | 物理打斷 | 雙酶(mei)切(qie)打斷，片段220-450bp |
測序深度 | ≥5×/樣(yang)本(ben) | ≥2×/樣本(ben) |
文庫類型 | PE 300~500bp（推薦） | dd-RAD文庫 |
樣本選擇 | 無(wu)明顯亞群分化的自然群體(ti)，個(ge)體(ti)數不(bu)少于(yu)200個(ge) | |
DNA樣本量(liang) | 總量≥0.5 μg，濃度≥10 ng/μl （單個樣本(ben)） | 總量(liang)≥0.5 μg，濃(nong)度≥10 ng/μl （總樣(yang)本） |
適用范圍(wei) | 有(you)參考基(ji)因組物(wu)種 | 參(can)考(kao)基(ji)因(yin)組較大的物種 |
項(xiang)目周(zhou)期 | 標準(zhun)分析40天(tian) | |
