染色(se)質免疫共沉淀技術(shu)（Chromatin Immunoprecipitation，ChIP）也稱結(jie)合位點分析法，是研(yan)究體內蛋白質與DNA 相互作用的(de)有(you)力工具，通常用于轉(zhuan)錄(lu)因(yin)子結(jie)合位點或組蛋白特異性修飾位點的(de)研(yan)究。將ChIP 與二(er)代測序技術(shu)相結(jie)合的(de)ChIP-Seq 技術(shu)，能夠檢測全基因(yin)組范圍(wei)內與組蛋白、轉(zhuan)錄(lu)因(yin)子等互作的(de)DNA區(qu)段。
ChIP-Seq 的(de)原理是：首先通過染色質免疫共沉淀技術(shu)（ChIP）特(te)異性地(di)富集目的(de)蛋(dan)白結合的(de)DNA 片段，并(bing)對其進行純化與文庫構建；然后對富集得到的(de)DNA片段進行高通量測序。研究人(ren)員通過將獲(huo)得的(de)序列標簽定位到基(ji)因組上，從(cong)而獲(huo)得全基(ji)因組范圍內與組蛋(dan)白、轉錄因子(zi)等(deng)互作的(de)DNA 區段信息(xi)。
Ilumina HiSeq2000、 Ion Proton
1. 原始數據整理、過濾及質量評估
2. ChIP-Seq序列與參考基因組序列的比對
3. Peak Calling（統計每個樣品的Peak片段信息）
4. Peak Annotation（根據已有的基因組數據庫注釋信息獲得Peak位點信息）
5. Motif預測、基因集分析
6. 全基因組范圍的峰值分布
7. 樣品間差異Peak分析
8. 基因組水平和感興趣區域的數據可視化
1.根(gen)據實際需求可個性化定(ding)制測序及分析(xi)方案。
2.嚴謹的實驗流(liu)程(cheng)和檢測結(jie)果，數據分析結(jie)果可(ke)信。
3.分析結(jie)果的圖表參考國(guo)際期刊設計，可直接(jie)用于文章(zhang)寫作。
4.與轉錄組等數據(ju)進行聯合分析，挖掘生物信息資(zi)源。
