微衛星(xing) (Microsatellite) 又(you)稱小串聯(lian)重復 (Short Tandem Repeats, STRs)(Simple Sequence Repeats, SSR)。在各種(zhong)真核(he)生物基因組中，分布廣且(qie)比較均勻。平均每(mei) 6 kb 長度中(zhong)就有(you) 1 個(ge)微衛(wei)星位(wei)點 (Beckmann ＆ Weber， 1992)。但隨著每個重復單位堿基長度(du)的增加，微衛星位點(dian)的總數減少。具有(you)突(tu)變速率快、多態性高等(deng)特(te)點(dian)。
SSR 分子標記開發是指對多個混(hun)合(he)樣(yang)品的(de)全基因組 DNA 構(gou)建基(ji)因組文庫，利用探針，采用磁(ci)珠(zhu)富集法(fa)富集得(de)到(dao)SSR 的中間區域(yu)及兩端(duan)的保守序列區域(yu)，采(cai)用(yong)二(er)代高通量測(ce)序平(ping)臺對文庫進行(xing)序列測(ce)定，利用(yong)生物信(xin)息學的分(fen)析方法獲得具有多態性的 SSR 序列并設計引(yin)物。
◇ 遺傳圖譜構建 ◇ 種質鑒定 ◇ 遺傳多樣性分析 ◇ 基因定位 ◇ 數量性狀基因座（QTL）分析
測序平臺(tai)及模(mo)式 | Illumina MiSeq, PE250 |
樣(yang)本選擇(ze)及數據量 | 1-5 個樣，推薦(jian)1.0 Gb； 5-10 個樣，推(tui)薦1.5 Gb； 10-20 個樣，推薦2.0 Gb； 備注：不同(tong)樣(yang)本分別提取DNA后(hou)等量(liang)混合建庫 |
DNA樣本量 | 總量(liang)≥1.0 μg，濃度≥20 ng/μl （總樣本(ben)） |
項目(mu)周期 | 標(biao)準分析(xi)36天 |
交付指標 | 提供不少于100對(dui)引物(wu)（經(jing)過篩(shai)選(xuan)后具有多態性(xing)的） |
參考基(ji)因組 | 有(you)參、無參均可 |
