宏轉錄組測序研究
宏轉錄(lu)組學(xue)(Metatranscriptomics)的(de)(de)研究對(dui)象是微生(sheng)物(wu)(wu)(wu)(wu)組mRNA，在獲取微生(sheng)物(wu)(wu)(wu)(wu)組總RNA并(bing)去除rRNA之后，反轉錄(lu)為cDNA，并(bing)構(gou)建合(he)適長度的(de)(de)插入片段(duan)文庫，對(dui)這些文庫進行雙(shuang)端(duan)(Paired-end，PE)高通量(liang)測序，從(cong)而(er)能精確定(ding)量(liang)整個菌(jun)群(qun)中具(ju)有活性的(de)(de)物(wu)(wu)(wu)(wu)種精細組成及其對(dui)應功能的(de)(de)表達水平，進而(er)鎖定(ding)菌(jun)群(qun)中的(de)(de)關鍵生(sheng)物(wu)(wu)(wu)(wu)標記物(wu)(wu)(wu)(wu)、闡明其生(sheng)物(wu)(wu)(wu)(wu)學(xue)意義。
1、直接(jie)對群落樣本(ben)中的(de)轉錄本(ben)進行(xing)測序，真實再現群落的(de)活性功能；
2、業界公認的總RNA 提取(qu)方法和rRNA 去(qu)除(chu)技術，穩定；
3、使用(yong)Illumina NovaSeq高(gao)通(tong)量測(ce)序平臺，速度更快(kuai)周期更短(duan)；
4、功能+物種(zhong)，雙管齊下；拼接+不拼接，各(ge)取(qu)所長，實現對物種(zhong)和功能的“高分辨(bian)率”精(jing)確定量(liang)；
5、根(gen)據樣本、數據特征，自動選擇分析流(liu)程(cheng)，多種(zhong)功能注(zhu)釋(shi)數據庫(ku)可(ke)選，優化宏基因組(zu)功能代謝(xie)譜注(zhu)釋(shi)；
6、通過(guo)多種多變(bian)量統計分析(xi)和機器學習方法，系(xi)統、深入地(di)挖(wa)掘宏轉錄組大數據中(zhong)差異相關的關鍵物(wu)(wu)(wu)種和關鍵功(gong)能，識別(bie)關鍵生物(wu)(wu)(wu)標記物(wu)(wu)(wu)。
實驗流程
微生物組總RNA提取→核糖體RNA去除→mRNA片段化→反轉錄cDNA→構建cDNA文庫并定量→上機進行高通量測序→生信分析
