細菌全基因組(zu)完成圖(tu)測(ce)序
細(xi)菌完(wan)成圖(tu)測(ce)(ce)序(xu)(xu)(xu)是指對(dui)基(ji)因(yin)組(zu)序(xu)(xu)(xu)列未(wei)知(zhi)或無近緣物種(zhong)基(ji)因(yin)組(zu)信(xin)息(xi)的(de)某個(ge)物種(zhong),構建不同插入片段的(de)基(ji)因(yin)組(zu)文(wen)庫,基(ji)于(yu) PacBio三(san)代單(dan)分子測(ce)(ce)序(xu)(xu)(xu)技術(shu)結合(he)二代高通量測(ce)(ce)序(xu)(xu)(xu)技術(shu),對(dui)這些文(wen)庫進行序(xu)(xu)(xu)列測(ce)(ce)定,利用生物信(xin)息(xi)學方(fang)法進行拼接,獲得完(wan)整(zheng)的(de)染色體及質粒序(xu)(xu)(xu)列,解析(xi)編碼(ma)信(xin)息(xi)和(he)表觀遺(yi)傳修飾信(xin)息(xi)。
應(ying)用領(ling)域
l 獲得完(wan)整的染(ran)色體序列圖譜
l 獲得(de)完(wan)整的(de)質(zhi)粒或 BAC 克隆子序列圖譜
l 解析甲基化(hua)修飾相關信息(6mA和4mC)
派森(sen)諾優勢
(1) 項目(mu)周(zhou)期短:完成圖項目周期(qi)(qi) 15 工作(zuo)日,平均(jun)項目周期(qi)(qi) 30 工作(zuo)日;
(2) 方(fang)案設(she)計合理:完(wan)成圖的(de)方(fang)案以三代平(ping)臺為主(zhu)、二代平(ping)臺為輔(fu),得到(dao)完(wan)整的(de)染色(se)體和(he)質粒(li)序列(lie)圖譜;
(3) 免費贈送待測菌(jun)株的菌(jun)種鑒定,以防菌(jun)株錯測;
(4) 拼(pin)接(jie)(jie)(jie)結(jie)果準確:三輪校(xiao)(xiao)正(zheng)(拼(pin)接(jie)(jie)(jie)前利(li)(li)用三代測(ce)序(xu)(xu)(xu)數(shu)(shu)(shu)據(ju)(ju)間的(de) Overlap 對測(ce)序(xu)(xu)(xu)數(shu)(shu)(shu)據(ju)(ju)進(jin)(jin)行校(xiao)(xiao)正(zheng);拼(pin)接(jie)(jie)(jie)后,利(li)(li)用三代測(ce)序(xu)(xu)(xu)數(shu)(shu)(shu)據(ju)(ju)對拼(pin)接(jie)(jie)(jie)結(jie)果進(jin)(jin)行第二輪校(xiao)(xiao)正(zheng);最后,利(li)(li)用高(gao)質(zhi)量的(de)二代測(ce)序(xu)(xu)(xu)數(shu)(shu)(shu)據(ju)(ju)對拼(pin)接(jie)(jie)(jie)結(jie)果進(jin)(jin)行多次校(xiao)(xiao)正(zheng))使得到(dao)的(de)基因組(zu)拼(pin)接(jie)(jie)(jie)結(jie)果更加準確;
(5) 項目(mu)經驗豐(feng)富:細菌完成圖已(yi)完成樣品數量近(jin) 300 例;
(6) 細(xi)節服務到位:無論(lun)是圈圖起(qi)始位點的(de)調(diao)整,還是起(qi)始密(mi)碼子的(de)翻譯(起(qi)始密(mi)碼子的(de)氨基(ji)酸均為甲硫氨酸),力(li)求做到滿意(yi)。