細菌(jun)全基因組完成圖測序
細菌完成(cheng)圖測序(xu)是指對基因(yin)組序(xu)列(lie)未知或無近(jin)緣物種基因(yin)組信(xin)(xin)(xin)息的某個(ge)物種,構建不同插(cha)入片段(duan)的基因(yin)組文(wen)(wen)庫,基于(yu) PacBio三代單分子測序(xu)技術結合(he)二代高(gao)通量測序(xu)技術,對這些(xie)文(wen)(wen)庫進行序(xu)列(lie)測定,利用生物信(xin)(xin)(xin)息學(xue)方法進行拼接,獲(huo)得完整的染色(se)體及(ji)質粒序(xu)列(lie),解析(xi)編碼信(xin)(xin)(xin)息和表觀遺(yi)傳修(xiu)飾信(xin)(xin)(xin)息。
應(ying)用領(ling)域
l 獲(huo)得(de)完整的染色(se)體序列圖譜
l 獲得完整(zheng)的質粒或 BAC 克隆(long)子(zi)序列圖譜
l 解(jie)析甲基化修飾相關(guan)信息(6mA和4mC)
派森諾(nuo)優勢
(1) 項目周期(qi)短:完(wan)成圖項目(mu)周(zhou)期(qi) 15 工(gong)作(zuo)日,平(ping)均(jun)項目(mu)周(zhou)期(qi) 30 工(gong)作(zuo)日;
(2) 方(fang)案(an)設(she)計(ji)合理:完成圖的方(fang)案(an)以三(san)代(dai)平臺為(wei)主、二代(dai)平臺為(wei)輔,得到完整(zheng)的染色體和質(zhi)粒序(xu)列(lie)圖譜(pu);
(3) 免費贈送待測菌株(zhu)的菌種鑒定,以防菌株(zhu)錯(cuo)測;
(4) 拼接(jie)(jie)結果準確(que):三輪(lun)(lun)校(xiao)(xiao)正(zheng)(拼接(jie)(jie)前(qian)利用(yong)三代測(ce)序數(shu)據間的 Overlap 對(dui)測(ce)序數(shu)據進(jin)行校(xiao)(xiao)正(zheng);拼接(jie)(jie)后(hou),利用(yong)三代測(ce)序數(shu)據對(dui)拼接(jie)(jie)結果進(jin)行第二輪(lun)(lun)校(xiao)(xiao)正(zheng);最(zui)后(hou),利用(yong)高質(zhi)量(liang)的二代測(ce)序數(shu)據對(dui)拼接(jie)(jie)結果進(jin)行多次校(xiao)(xiao)正(zheng))使得到的基因組(zu)拼接(jie)(jie)結果更加準確(que);
(5) 項目經驗豐富:細菌完成圖(tu)已(yi)完成樣品數量近 300 例(li);
(6) 細節(jie)服務(wu)到位(wei):無論是圈(quan)圖(tu)起始位(wei)點的(de)調(diao)整,還是起始密碼子的(de)翻譯(起始密碼子的(de)氨基(ji)酸(suan)均為甲硫氨酸(suan)),力求做(zuo)到滿意。