微衛(wei)星(microsatellite analysis)即短(duan)串聯(lian)重復(fu)序(xu)(xu)列(lie)(lie)(Short tandem repeat,STR),是由幾(ji)個堿基對(dui)作(zuo)為單位,串聯(lian)重復(fu)形成的一(yi)類DNA序(xu)(xu)列(lie)(lie),由于(yu)(yu)(yu)單位重復(fu)數(shu)目(mu)的變(bian)化,構成了STR基因座的遺(yi)傳多(duo)(duo)態性(xing)。由于(yu)(yu)(yu)其序(xu)(xu)列(lie)(lie)簡(jian)(jian)短(duan) , 通過(guo) PCR 很(hen)容易(yi)從(cong)基因組 DNA 中(zhong)特異性(xing)地擴增(zeng)出(chu)來 , 大(da)大(da)簡(jian)(jian)化了微衛(wei)星多(duo)(duo)態性(xing)分(fen)析(xi)的操作(zuo)。研(yan)究者需在目(mu)標基因座設計一(yi)對(dui)或多(duo)(duo)對(dui)引物(wu) , 通過(guo) PCR 反(fan)應從(cong)模板(ban) DNA 中(zhong)將該基因擴增(zeng)出(chu)來 , 然后(hou)使用測序(xu)(xu)儀進行(xing)電泳分(fen)離分(fen)析(xi)即可。它(ta)具(ju)有分(fen)布廣泛(fan),易(yi)于(yu)(yu)(yu)檢測,信(xin)息量大(da),有高度多(duo)(duo)態性(xing)并遵循(xun)孟(meng)德爾共(gong)顯(xian)性(xing)遺(yi)傳等優點。目(mu)前STR分(fen)析(xi)已廣泛(fan)應用于(yu)(yu)(yu)遺(yi)傳制圖、連鎖性(xing)分(fen)析(xi)、親子鑒定、疾病(bing)基因定位和物(wu)種(zhong)多(duo)(duo)態性(xing)研(yan)究等諸多(duo)(duo)領域。
一 、分型原理
利(li)用熒光(guang)標記的PCR引物對多(duo)個微(wei)衛星多(duo)態(tai)位(wei)點(dian)進行(xing)擴增,然(ran)后采(cai)用高(gao)分辨率膠電泳(yong)(如用于測序(xu)的毛細管電泳(yong)等)對擴增片(pian)斷(duan)進行(xing)分離,通過熒光(guang)檢測系統(如ABI測序(xu)儀)確(que)定擴增片(pian)斷(duan)的長度,實現對微(wei)衛星多(duo)態(tai)位(wei)點(dian)的分型。
我公司采用(yong)ABI 3730測(ce)序儀對STR進行DNA片段分析,提(ti)供完整解決方案:
實驗(yan)方案的設計, 包括熒光標(biao)記(ji)的選擇,引物的設計、合(he)成(cheng)和標(biao)記(ji),內標(biao)的選用(yong)等等;
完(wan)成熒(ying)光 PCR ,并在測序儀上(shang)完(wan)成電泳(yong)掃(sao)描 , 數據采集(ji);
用軟件對分型數據(ju)進行處理(li)分析(xi) , 提供產物片段大小、數量(liang)多少的信(xin)息數據(ju);
我們(men)最終提(ti)供微衛星座(zuo)位PCR產物全自(zi)動檢測(ce)及(ji)分型結(jie)果。
二(er)、 客(ke)戶提(ti)供
1)基因組DNA:至少100 ng 樣品(pin)(每個多(duo)態性位點需樣品(pin)3-5 ul,濃度(du)為30~50 ng/ul);樣品(pin)溶解在ddH2O中,如果不(bu)是,請注明其成分(fen)以及可能殘留(liu)的抑制劑類型(xing)。
2)PCR產(chan)物(wu):特(te)異(yi)性好。
3)如需設(she)計引物,請提(ti)供目的片段序列或者微(wei)衛星檢測位點,引物設(she)計好后需客(ke)戶確(que)認。
三、 實驗步驟
客戶提供血液樣本或(huo)DNA樣本——確定STR位點,設計合成特異PCR擴增引物(熒光標記引物)——進行PCR擴增,通過測序儀電泳檢測,獲得擴增片段相關數據——ABI3730XL 測序儀讀出擴增片段大小信息。
四 、收費標準
定(ding)區域位點(dian)的掃描
普通引物(wu):1.50元/堿(jian)基
引物費(fei)用:我們推薦的熒(ying)光標記有FAM 、 HEX 、 NED 等(deng),合成費(fei)用查詢合成報價
PCR費用:20元/樣本,包括預實驗和檢測。
分(fen)型費(fei)用:如(ru)果您已經完(wan)成(cheng) PCR 擴增,進行(xing)電泳分(fen)型、數據處理,包(bao)含(han)內標價格為(wei) 10元(yuan) / 樣本(ben)。不包(bao)含(han)內標價格為(wei) 8元(yuan) / 樣本(ben),不足 96 個的按照 96 個收費(fei)。