基因組從頭測序（de novo sequencing），主要針對基因組序列未知或參考基因組組裝不理想的物種，構建不同類型的基因組DNA文庫，并進行序列測定。然后使用生物信息學方法對序列進行拼接、組裝和注釋，從而繪制該物種完整的基因組序列信息。簡單基因組：重復序列低于50%，且二倍體雜合度低于0.5%的物種。
復雜基(ji)因組(zu)：重復序列高于(yu)50%，或二倍體雜合(he)度高于(yu)0.5%，或其他多(duo)倍體物種。
產品參數
測序方(fang)案(an) | 測序策略 | 交付指(zhi)標 | 項目周(zhou)期 | |
簡(jian)單基因組(zu) | 純(chun)三代 | 文(wen)庫：20Kb 三代（80X）+10XGenomics/Bionano/ Hi-C | Contig N50≥ 1Mb | （二代）40個自然日（標準分析）； （二代+三代+Hic）75個自然日（測序+組裝+注釋） |
3+2混合拼接 | 三代（40X）+二代（PE, 100X） | Contig N50≥ 500Kb | ||
復雜基因(yin)組 | 純三(san)代 | 文庫：20Kb 三(san)代（100X）+10XGenomics/Bionano/ Hi-C | 視物(wu)種而定(ding) | |
3+2混合拼接 | 三代（40X）+二代（PE, 100X） | Contig N50≥ 200Kb | ||
哺乳動物和鳥(niao)類(lei) | 純三代 | 文庫(ku)：20Kb 三(san)代（80X） | Contig N50≥ 3Mb | |
3+2混合拼(pin)接(jie) | 三代(dai)（40X）+二代(dai)（PE, 100X） | Contig N50≥ 1Mb |
