CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)是蛋白(bai)質-DNA互作(zuo)關系研(yan)(yan)究(jiu)的新方法,是新一(yi)代超(chao)(chao)微(wei)量(liang)ChIP-Seq技術(shu)(shu),適用于無ChIP級(ji)別抗(kang)體的蛋白(bai)研(yan)(yan)究(jiu)。與傳(chuan)統的ChIP-Seq研(yan)(yan)究(jiu)方法相比,該技術(shu)(shu)無需交(jiao)聯(lian)、超(chao)(chao)聲打斷、末端抹平和接(jie)頭(tou)連(lian)接(jie)等操(cao)(cao)作(zuo),因(yin)(yin)此具有省時(shi)高效、所需的樣品量(liang)少、背景信號低和可重復性(xing)(xing)好等優(you)點,甚至可用于單細(xi)胞水(shui)平測序。CUT&Tag有望將(jiang)蛋白(bai)質-DNA互作(zuo)的研(yan)(yan)究(jiu)變(bian)成一(yi)種類似PCR反應的常(chang)規操(cao)(cao)作(zuo),對基因(yin)(yin)調控、表觀遺傳(chuan)等領域(yu)的研(yan)(yan)究(jiu)具有革命(ming)性(xing)(xing)的意義。
技(ji)術原(yuan)理:CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)技(ji)術,該技(ji)術利用一(yi)抗(kang)(kang)靶向結合(he)目的(de)(de)(de)蛋(dan)白(bai),二抗(kang)(kang)孵(fu)育放大信號,創新性的(de)(de)(de)pA-Tn5融(rong)合(he)蛋(dan)白(bai)與一(yi)抗(kang)(kang)和(he)二抗(kang)(kang)中的(de)(de)(de)Fc區結合(he),Mg2+激活(huo)pA-Tn5的(de)(de)(de)Tn5酶活(huo)性后切(qie)割目標區域(yu)并(bing)加上接(jie)頭(tou),經PCR擴(kuo)增就可獲得目標蛋(dan)白(bai)結合(he)區域(yu)的(de)(de)(de)文庫。簡(jian)化建庫操作,提高了(le)信噪(zao)比(bi),實現(xian)了(le)低細(xi)胞(bao)量樣(yang)本(ben)研究組蛋(dan)白(bai)修飾(shi)和(he)轉錄因子的(de)(de)(de)目標。
推薦(jian)平臺:Novaseq 6000 PE150
生物信息分析
1.原始數(shu)據整理、過濾及(ji)質(zhi)量評估
2.與參(can)考基因組序列比(bi)對(dui)
3.Peak Calling(統計每個樣品的Peak片段信息)
4.基因附近及Peak中(zhong)心信號(hao)分布(bu)圖
5.Peak序列Motif及注釋分析
6.Peak鄰近基因功能分析
7.差異Peak序列Motif及注釋分析
8.差異Peak鄰近(jin)基因(yin)功(gong)能(neng)分析
9.Overlap基因功能分析
派森(sen)諾的優勢
1.根據(ju)實際需求可(ke)個性化定制測序及(ji)分(fen)析(xi)方案。
2.嚴謹的實驗(yan)流程和檢測結(jie)果,數據分(fen)析結(jie)果可(ke)信(xin)。
3.分析結果的圖表(biao)參考國際期刊設計,可(ke)直(zhi)接用于文章(zhang)寫作。
4.與轉錄組等數據進行聯合分析,挖掘生(sheng)物信息資源(yuan)。