利用(yong)高通量測序檢測轉座(zuo)酶(mei)易接(jie)近的染色質的技(ji)術。在 ATAC-seq 技(ji)術中(zhong)，DNA 探(tan)針（作為轉座(zuo)子發揮(hui)作用(yong)）通過酶(mei)促反應（轉座(zuo)酶(mei)Tn5）被整合到(dao)基因組的開(kai)放(fang)區(qu)域，然后通過測序來鑒定這些區(qu)域。
ATAC-seq 技術(shu)可以進行樣本之間差異的(de)(de)(de)(de)染色(se)質(zhi)開(kai)放(fang)位點的(de)(de)(de)(de)比(bi)較。ATAC-seq 技術(shu)作為檢測表(biao)(biao)觀(guan)遺傳-染色(se)質(zhi)開(kai)放(fang)狀(zhuang)態(tai)現象的(de)(de)(de)(de)方式，與樣本基(ji)因(yin)(yin)(yin)(yin)表(biao)(biao)達(da)譜緊密(mi)相連，從靶(ba)標基(ji)因(yin)(yin)(yin)(yin)的(de)(de)(de)(de)表(biao)(biao)觀(guan)狀(zhuang)態(tai)關(guan)聯(lian)到表(biao)(biao)達(da)水平(ping)，具(ju)有強(qiang)大的(de)(de)(de)(de)數據(ju)挖掘作用(yong)。此外，通過(guo)關(guan)聯(lian)基(ji)因(yin)(yin)(yin)(yin)組(zu)、外顯子(zi)(zi)，染色(se)質(zhi)免疫共沉淀（組(zu)蛋(dan)白修(xiu)飾(shi)或轉錄因(yin)(yin)(yin)(yin)子(zi)(zi)結合）測序(xu)信(xin)息，形成：表(biao)(biao)觀(guan)調(diao)控-基(ji)因(yin)(yin)(yin)(yin)組(zu)-基(ji)因(yin)(yin)(yin)(yin)表(biao)(biao)達(da)的(de)(de)(de)(de)完(wan)整(zheng)調(diao)控鏈(lian)。
實驗設計：
實(shi)驗組(zu) vs 對照(zhao)組(zu)
測序模式：用Illumina Novaseq 6000測序，測序策略為PE150
生(sheng)物(wu)學重復：推薦細(xi)胞系、模(mo)式(shi)生(sheng)物(wu)做2-3次生(sheng)物(wu)學重復；人(ren)的組織可以做1次生(sheng)物(wu)學重復。
