分析(xi)內(nei)容:
分析結果展示:
Peak Calling
對 Peak 注(zhu)釋分(fen)析結果中 Peak 在所覆蓋的基(ji)因的功能性區域上的分(fen)布進(jin)行統計(ji),并(bing)使(shi)用 ChIPseeker 包將統計(ji)結果繪制(zhi)成每個樣本分(fen)開查看(kan)的餅圖如下(xia):
Peak在(zai)功能(neng)元件上的分(fen)布
Peak 鄰近基因GO富集柱狀圖
挑選了Peak鄰近基因顯著富集的GO條(tiao)目中的前20條(tiao)繪制柱狀圖進行(xing)展示:
Peak 鄰近基因 GO 富集柱(zhu)狀圖(tu)
差異Peak鄰近基因Pathway富集柱狀圖和氣泡圖
差異Peak鄰近基因Pathway富集氣泡圖(tu)
GO網絡圖分析
做完Pathway富(fu)集(ji)(ji)分(fen)(fen)析后,可能(neng)會(hui)得到幾百甚至幾千個富(fu)集(ji)(ji)到的(de)(de)Pathway條(tiao)目(mu)(mu), 為了有(you)效的(de)(de)利(li)用(yong)富(fu)集(ji)(ji)分(fen)(fen)析的(de)(de)結果,可以通過條(tiao)目(mu)(mu)之間的(de)(de)關系找到處于(yu)更(geng)關鍵位置(zhi)的(de)(de)Pathway條(tiao)目(mu)(mu):
GO網絡圖