擴(kuo)增子/功(gong)能基(ji)因測序借助合適的(de)類群(qun)特異(yi)性引(yin)物,可以檢測菌群(qun)中特定種類/功(gong)能微生(sheng)物的(de)特征序列,反映菌群(qun)中該(gai)特定類群(qun)微生(sheng)物的(de)組成結構,從而(er)發現它們的(de)分布特征,闡明(ming)樣本間多樣性和組成差(cha)異(yi),進(jin)而(er)揭(jie)示(shi)該(gai)類群(qun)微生(sheng)物中與差(cha)異(yi)相關聯的(de)關鍵成員。
項(xiang)目流程
微(wei)生物(wu)組總DNA提取→目標片段PCR擴增→擴增產物(wu)檢(jian)測定量→測序文(wen)庫制備(bei)→上機(ji)進(jin)行(xing)高通(tong)量測序 →生信分析
產品特點
對特定(ding)種類(lei)/功(gong)能的(de)微(wei)生(sheng)(sheng)物(wu)群(qun)落進行研(yan)究,比如產甲烷微(wei)生(sheng)(sheng)物(wu)、硝化/反硝化微(wei)生(sheng)(sheng)物(wu)等(deng)特定(ding)的(de)微(wei)生(sheng)(sheng)物(wu)類(lei)群(qun)等(deng),好比拿了一把“放大鏡”,而消除了其它(ta)不相(xiang)干微(wei)生(sheng)(sheng)物(wu)類(lei)群(qun)的(de)干擾(rao)。
實驗(yan)經驗(yan)豐富(fu):
樣本類型全。涵蓋動(dong)植物、土壤、水體等(deng)各類生境;
基因種類多。涵蓋(gai)碳氮磷硫(liu)代(dai)謝、線粒體(ti)、葉綠體(ti)、重金(jin)屬抗性等;
派(pai)森諾分析深入:
FrameBot校正(zheng)。糾(jiu)正(zheng)移(yi)碼錯誤(wu),去除非(fei)目的序列;BROCC注釋算法。替代BLAST,確保“真陽性(xing)”;NCBI-nt/nr數(shu)據庫、功(gong)能基(ji)因限定參考子集。