菌群組成譜(pu)全長(chang)測序研究
基于(yu)PacBio三代測序平臺,能夠讀取群(qun)落微生態系統中微生物的rRNA基因/ITS全長序列(lie)(lie),不受制于(yu)短序列(lie)(lie)的局限性(xing),并確保全長序列(lie)(lie)的測序,從而在種甚至菌(jun)(jun)株等精細水(shui)平,解(jie)析菌(jun)(jun)群(qun)多樣性(xing)和組成譜。
產品特(te)色
l 深入獲(huo)取微生物群(qun)落(luo)的精細組成(cheng)信息;
l 預測(ce)微(wei)生物(wu)群落的潛在代謝功能,并指導(dao)后(hou)續宏基因組測(ce)序研究;
l 通過“全微(wei)生物組關聯研(yan)究(Microbiome-Wide Association Studies,MWAS)”,鑒(jian)定與表型/組間差異(yi)相關的關鍵物種。
應用領域
l 微生物組與環(huan)境互作(zuo)關(guan)系(xi)的研究;
l 微生物組與宿主共(gong)生關(guan)系的研究(jiu);
l 微生(sheng)物組在臨床(chuang)醫學和(he)精準醫療領域的應(ying)用(yong);
l 微生物組在發酵工藝、食品加工/檢測(ce)等行業的(de)應用。
派森諾(nuo)優勢
l 自動化、完善的(de)DNA提(ti)取擴增(zeng)體(ti)系和樣本(ben)前處理流程;
l 派森諾擁有(you)PacBio RSII和(he)Sequel兩種單分子(zi)實時(shi)測(ce)序平臺(tai),提供(gong)測(ce)序服務;
l Greengenes/Silva/HOMD/RDP/Unite/MaarjAM等(deng)多個物種注釋數據庫,優(you)化物種的分類鑒定;
l 專(zhuan)家教(jiao)授(shou)多方位支(zhi)持,可(ke)按需個性化(hua)定制;
l 項目經驗豐(feng)富,涵(han)蓋水樣、活(huo)性污泥、土壤、排泄(xie)物、體(ti)液、組織等各類樣本。
PacBio和(he)Illumina平臺對菌群16S rRNA基因測序(xu)結果的(de)比較,并改善物(wu)種分(fen)類信息的(de)不確定(ding)性。
派(pai)森諾菌(jun)群組成譜全長測序分(fen)析流程