種水平(ping)的精細組成圖
上圖中，橫(heng)坐標(biao)依據樣(yang)本名排(pai)列，每一(yi)個柱形圖代(dai)表(biao)一(yi)個樣(yang)本，并以顏(yan)色區分(fen)(fen)各(ge)分(fen)(fen)類(lei)單元(yuan)，縱坐標(biao)代(dai)表(biao)各(ge)分(fen)(fen)類(lei)單元(yuan)的相(xiang)(xiang)對(dui)豐度(du)，柱子越(yue)長，該(gai)分(fen)(fen)類(lei)單元(yuan)在對(dui)應樣(yang)本中的相(xiang)(xiang)對(dui)豐度(du)越(yue)高。
組間差異顯(xian)著的(de)種水平(ping)分(fen)類單元的(de)豐(feng)度分(fen)布小提(ti)琴圖
上圖中(zhong)，橫(heng)(heng)坐標為(wei)組(zu)間差異(yi)顯著的(de)(de)(de)種水(shui)(shui)平分類(lei)單元(yuan)(yuan)，縱(zong)坐標為(wei)各(ge)分類(lei)單元(yuan)(yuan)在各(ge)樣本（組(zu)）內的(de)(de)(de)序列量，以(yi)小(xiao)提琴圖結合箱線圖的(de)(de)(de)形式展示(shi)(shi)：其中(zhong)，小(xiao)提琴圖可以(yi)直觀地顯示(shi)(shi)數據的(de)(de)(de)分布特征，“小(xiao)提琴”的(de)(de)(de)“胖瘦(shou)”反映了樣本數據分布的(de)(de)(de)密度(du)高(gao)低（寬度(du)越(yue)寬，表(biao)(biao)明該序列量水(shui)(shui)平所對應的(de)(de)(de)樣本越(yue)多）；箱線圖邊框代(dai)表(biao)(biao)上下四(si)(si)分位數間距（Interquartile range，IQR），橫(heng)(heng)線代(dai)表(biao)(biao)中(zhong)位值，上下觸須分別(bie)代(dai)表(biao)(biao)上下四(si)(si)分位以(yi)外的(de)(de)(de)1.5倍(bei)IQR范圍(wei)，符號“?”表(biao)(biao)示(shi)(shi)超過范圍(wei)的(de)(de)(de)極端值。
種水平關聯(lian)網絡分析(xi)圖
上圖中，各節點(dian)(dian)的(de)圓圈代表種水(shui)平的(de)各分類單元(yuan)，以不同的(de)顏色標識，節點(dian)(dian)之間的(de)連接(jie)表明兩個物種之間存在相(xiang)關(guan)性，紅線表明正相(xiang)關(guan)，綠線表明負相(xiang)關(guan)。通過某節點(dian)(dian)的(de)連接(jie)越(yue)多(duo)，表明該物種與菌群中其它成員的(de)關(guan)聯越(yue)密切。
菌群代謝功能預測的KEGG直系同源基(ji)因(yin)簇（KO）豐度熱(re)圖
上圖(tu)(tu)中，樣本(ben)先按照彼(bi)此(ci)之間功(gong)(gong)能類群(qun)豐(feng)度(du)分布的(de)相似度(du)進行(xing)聚類，根(gen)據聚類結(jie)果(guo)橫向(xiang)依次(ci)排(pai)(pai)列。同理，功(gong)(gong)能類群(qun)也按照彼(bi)此(ci)在不同樣本(ben)中分布的(de)相似度(du)進行(xing)聚類，根(gen)據聚類結(jie)果(guo)縱向(xiang)依次(ci)排(pai)(pai)列。圖(tu)(tu)中，紅色(se)代(dai)(dai)表在對(dui)應樣本(ben)中豐(feng)度(du)較(jiao)高的(de)功(gong)(gong)能類群(qun)，綠色(se)代(dai)(dai)表豐(feng)度(du)較(jiao)低的(de)功(gong)(gong)能類群(qun)。
