基(ji)于PacBio三(san)代測序(xu)平臺的(de)全(quan)長(chang)(chang)轉錄組測序(xu)(Iso-Seq),可(ke)(ke)直接(jie)(jie)獲得mRNA的(de)全(quan)長(chang)(chang)序(xu)列(lie),可(ke)(ke)更為準確地解讀mRNA的(de)結構(gou)信息。通過全(quan)長(chang)(chang)轉錄組測序(xu),可(ke)(ke)克服無(wu)參考基(ji)因(yin)組物種轉錄本拼接(jie)(jie)短、信息不完整的(de)難題,獲取全(quan)長(chang)(chang)mRNA序(xu)列(lie),實(shi)現同源異(yi)構(gou)體分(fen)析(xi),單(dan)堿基(ji)變(bian)異(yi)檢(jian)測, 可(ke)(ke)變(bian)剪接(jie)(jie)分(fen)析(xi),同源基(ji)因(yin)識(shi)別及等位基(ji)因(yin)識(shi)別。
全長轉錄組實驗設計思路可以是單個(ge)(ge)樣(yang)品(pin)進(jin)行測序,與參考基因(yin)組進(jin)行比(bi)較進(jin)行結(jie)構分析(xi)(xi),亦可以對(dui)多個(ge)(ge)樣(yang)品(pin)進(jin)行基因(yin)結(jie)構方(fang)面的(de)差異(yi)比(bi)較分析(xi)(xi)。