宏基因(yin)組測(ce)序研究
宏基因組(zu)學(Metagenomics)研究通(tong)過全基因組(zu)鳥槍法(fa)(Whole Genome Shotgun，WGS)測序(xu)(xu)策略，將提取獲得(de)的(de)(de)微生(sheng)物(wu)組(zu)總DNA隨機打斷為短片(pian)段(duan)，并構建(jian)合適長度的(de)(de)插入片(pian)段(duan)文庫，對這些文庫進(jin)行雙端(Paired-end，PE)高(gao)通(tong)量測序(xu)(xu)，從而(er)能精細地展示(shi)整(zheng)個(ge)菌(jun)群的(de)(de)功能代謝譜和物(wu)種精細組(zu)成譜，進(jin)而(er)在(zai)組(zu)成和功能水(shui)平分別挖掘關鍵生(sheng)物(wu)
標記(ji)物，從原(yuan)理上闡(chan)明微(wei)生物群落在生態系統中發揮(hui)作用的根本機(ji)制。
宏基因組測(ce)序項目流(liu)程
微生(sheng)(sheng)物組總DNA提取→DNA片段化(hua)→連接(jie)(jie)接(jie)(jie)頭序列(lie)→純化(hua)、富(fu)集(ji)DNA片段→測序文庫定量→上機進行高通量測序→生(sheng)(sheng)信(xin)分析
1、直接對群(qun)(qun)落樣本中的基因片段進行測序，真實再現群(qun)(qun)落復雜而精密的生態功能；
2、樣本類型涵(han)蓋(gai)各類生(sheng)境，微量提取成功(gong)率(lv)高；
3、使用(yong)Illumina NovaSeq超高通(tong)量測序(xu)平臺，速度更快周(zhou)期更短(duan)；
4、功(gong)能(neng)+物(wu)種，雙(shuang)管齊下；拼接+不拼接，各取所長，實(shi)現對物(wu)種和功(gong)能(neng)的(de)“高分辨率(lv)”定(ding)量(liang)；
5、根據樣(yang)本(ben)、數據特(te)征，自動選擇分析(xi)流程，多種(zhong)功能(neng)注釋數據庫可(ke)選，優(you)化宏基因組功能(neng)代謝譜注釋；
6、通過(guo)多(duo)(duo)種(zhong)多(duo)(duo)變(bian)量統計(ji)分(fen)析(xi)和機器學習方法，系統、深入地(di)挖掘宏基因組(zu)大數據中差異(yi)相關(guan)(guan)的關(guan)(guan)鍵物(wu)種(zhong)和關(guan)(guan)鍵功(gong)能，識(shi)別關(guan)(guan)鍵生物(wu)標記(ji)物(wu)。
