擴(kuo)增(zeng)子/功能基因測(ce)序借助合適的(de)類(lei)群特(te)異(yi)性(xing)引物(wu)(wu)(wu),可以檢測(ce)菌群中特(te)定種類(lei)/功能微(wei)生物(wu)(wu)(wu)的(de)特(te)征序列,反映菌群中該(gai)特(te)定類(lei)群微(wei)生物(wu)(wu)(wu)的(de)組成結構,從而發現它們的(de)分布特(te)征,闡(chan)明樣(yang)本間多樣(yang)性(xing)和組成差異(yi),進而揭示該(gai)類(lei)群微(wei)生物(wu)(wu)(wu)中與差異(yi)相關(guan)聯的(de)關(guan)鍵成員(yuan)。
項目流程
微生物(wu)組總DNA提取→目(mu)標片段(duan)PCR擴增→擴增產(chan)物(wu)檢測定量→測序(xu)文庫制備(bei)→上機進(jin)行高通量測序(xu) →生信分析
產品特點
對特定(ding)種類(lei)/功能的(de)微生(sheng)物(wu)(wu)群落進行研究,比如產甲(jia)烷微生(sheng)物(wu)(wu)、硝化/反硝化微生(sheng)物(wu)(wu)等特定(ding)的(de)微生(sheng)物(wu)(wu)類(lei)群等,好(hao)比拿了一把(ba)“放大鏡”,而消除了其(qi)它不相干微生(sheng)物(wu)(wu)類(lei)群的(de)干擾。
實驗(yan)經(jing)驗(yan)豐富:
樣(yang)本類型全。涵蓋(gai)動植(zhi)物(wu)、土(tu)壤、水體(ti)等各(ge)類生境;
基因種類多(duo)。涵蓋(gai)碳氮磷(lin)硫代謝、線(xian)粒體、葉綠體、重(zhong)金屬抗性等(deng);
派森諾(nuo)分析深入(ru):
FrameBot校正(zheng)。糾正(zheng)移碼錯誤,去除(chu)非(fei)目的序列(lie);BROCC注釋算法。替(ti)代(dai)BLAST,確保“真(zhen)陽性(xing)”;NCBI-nt/nr數據庫、功(gong)能(neng)基因(yin)限定(ding)參考子集。