全長轉錄組測序
基(ji)(ji)于PacBio三代(dai)測(ce)序(xu)平臺的全(quan)長轉(zhuan)(zhuan)錄(lu)組(zu)測(ce)序(xu)(Iso-Seq),可(ke)直(zhi)接獲(huo)得mRNA的全(quan)長序(xu)列,可(ke)更為準確地解讀mRNA的結構(gou)信息。通過全(quan)長轉(zhuan)(zhuan)錄(lu)組(zu)測(ce)序(xu),可(ke)克服(fu)無參考基(ji)(ji)因組(zu)物種轉(zhuan)(zhuan)錄(lu)本(ben)拼接短(duan)、信息不完整的難題(ti),獲(huo)取(qu)全(quan)長mRNA序(xu)列,實現同源異構(gou)體(ti)分(fen)(fen)析,單堿基(ji)(ji)變異檢測(ce), 可(ke)變剪接分(fen)(fen)析,同源基(ji)(ji)因識別(bie)及等(deng)位基(ji)(ji)因識別(bie)。
方案設計
全長轉錄(lu)組實驗設計思(si)路可(ke)以(yi)是(shi)單個樣品進(jin)行測序,與參考基因組進(jin)行比(bi)較進(jin)行結(jie)構分(fen)析(xi),亦可(ke)以(yi)對多個樣品進(jin)行基因結(jie)構方面的差(cha)異比(bi)較分(fen)析(xi)。
