利用全基因組重測序或簡化基因組測序(dd-RAD)技術獲得某物種自然群體各亞群的基因組信息,通過與參考基因組比對或聚類分析的方法得到大量變異信息,基于SNP信息討論群體的遺傳結構、基因交流情況、物種形成機制以及群體進化動態等生物學問題。
群體(ti)(ti)進化(hua)研究可(ke)以(yi)獲取物(wu)種(zhong)的(de)變異信息,從而獲得(de)生物(wu)群體(ti)(ti)的(de)遺傳特征。探究群體(ti)(ti)進化(hua)可(ke)以(yi)為動植(zhi)物(wu)遺傳育種(zhong)和瀕臨滅絕(jue)的(de)動植(zhi)物(wu)保護等提供(gong)理論依據,同時也(ye)可(ke)以(yi)為地球地質、生態、氣候、歷史人類活動變化(hua)的(de)研究提供(gong)生物(wu)學佐(zuo)證。
產品參數
基(ji)于重測序 | 基于簡化 | |
測(ce)序(xu)平臺及模式 | Illumina Novaseq, PE150 | |
測序(xu)深度 | >50x/個體(ti) | 混合(he)建(jian)庫(ku);Tag數≥20萬,平均10x/Tag |
項目周期 | 標準分析40天 | 標準分析(xi)50天 |
樣本選擇 | 同(tong)一物種自然群(qun)(qun)體(ti)的不同(tong)亞(ya)種(或品系),每個亞(ya)群(qun)(qun)樣(yang)本數≥10; 群(qun)(qun)體(ti)數≥3;總體(ti)不少(shao)于(yu)30個樣(yang)本 | |
DNA樣本量 | 總量≥0.5 μg,濃度≥10 ng/μl (單個樣本) | 總量≥0.5 μg,濃(nong)度≥10 ng/μl (總樣本) |
參考基因(yin)組 | 必須有參 | 無參或參考基因組較(jiao)大 |