一、數據質量
NextSeq下機數據R1端堿(jian)基質量分布圖
NextSeq下(xia)機數據R2端(duan)堿(jian)基(ji)質量分布圖
NextSeq測試(shi)數據質量表格
?從以上數(shu)據(ju)(ju)圖表可以發現,NextSeq_PE300結果數(shu)據(ju)(ju)質量更高,堿(jian)基質量Q30平均可以達到90%左右,遠遠高出官方提供標準,數(shu)據(ju)(ju)利用率也會大(da)幅提升;
二、數據(ju)分(fen)析結(jie)果(guo)展示
NovaSeq與NextSeq——門和(he)屬水(shui)平物種相對(dui)豐度(du)柱形圖
MiSeq與NextSeq——門和屬水平(ping)物(wu)種(zhong)相(xiang)對豐(feng)度柱形圖
?無論(lun)是門水(shui)平(ping)還(huan)是屬水(shui)平(ping)物種組(zu)(zu)成分(fen)析結果,都(dou)可以看出,幾種測序平(ping)臺得到的物種組(zu)(zu)成及豐度(du)分(fen)布保持(chi)高度(du)一致,優勢物種分(fen)布無差別(bie);
NovaSeq與NextSeq——Alpha多樣(yang)性分析(xi)結(jie)果
MiSeq與(yu)NextSeq——Alpha多(duo)樣性(xing)分析(xi)結果(guo)
?Alpha多(duo)樣(yang)性分析結果顯示,幾種測序平臺間樣(yang)品(pin)內微生物的豐(feng)度(du)程度(du)及多(duo)樣(yang)性程度(du)基(ji)本一致;
NovaSeq與(yu)NextSeq——Beta多(duo)樣性分析結果
MiSeq與NextSeq——Beta多樣性(xing)分析(xi)結(jie)果
?同時,Beta多(duo)樣性分析結果顯示(shi),幾(ji)種測(ce)序平臺的同一(yi)樣品物種組成及豐度分布基本一(yi)致,且(qie)高度相關(guan)。
上(shang)(shang)述結果表明,作(zuo)為(wei)Illumina測(ce)序系統中的擁有長(chang)度長(chang)模式的“新貴(gui)”,NextSeq平(ping)臺(tai)不(bu)僅(jin)能獲得和(he)NovaSeq與MiSeq平(ping)臺(tai)高度一致的菌群組成(cheng)結構(gou),而且在測(ce)序質量(liang)上(shang)(shang),也(ye)相比(bi)Q30>70%的MiSeq PE300模式官方質控標準,有了大(da)幅提升!更(geng)重要的是(shi),NextSeq的測(ce)序通量(liang)至少是(shi)MiSeq平(ping)臺(tai)的4倍以上(shang)(shang),能輕(qing)而易(yi)舉的實現大(da)樣(yang)品(pin)量(liang)、高測(ce)序量(liang)的長(chang)片段(duan)樣(yang)品(pin),對(dui)于低豐度物種的探測(ce)、以及(ji)菌群整體組成(cheng)的分辨率也(ye)將更(geng)精細!