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科研服務

全基因組甲基化測序

DNA 甲(jia)基化對生命活動重要,是基因調控(kong)的(de)手(shou)段之一 ( 即通過對位于啟動子(zi)及第一外顯子(zi)區的 CpG 島的甲基化而抑制基因(yin)的表達(da) ),它在(zai)基因表達調控(kong)、腫(zhong)瘤研(yan)(yan)究(jiu)、染色質重(zhong)塑、遺(yi)傳印(yin)記(ji)、疾病研(yan)(yan)究(jiu)、胚(pei)胎發育、環境與表觀遺(yi)傳和表觀異質性等方面起(qi)重(zhong)要的作用,是表觀遺(yi)傳學(xue)研(yan)(yan)究(jiu)的熱點。



方案設計


全基(ji)(ji)(ji)(ji)(ji)(ji)因組(zu)(zu)甲(jia)(jia)基(ji)(ji)(ji)(ji)(ji)(ji)化(hua)實驗(yan)設(she)計思(si)路為(wei)差異比較,常(chang)見的(de)類型為(wei)實驗(yan)組(zu)(zu)與(yu)(yu)對照(zhao)組(zu)(zu) (case VS control),進(jin)(jin)行兩兩比較。通過重(zhong)亞硫酸鹽對基(ji)(ji)(ji)(ji)(ji)(ji)因組(zu)(zu) DNA 進(jin)(jin)行處理,將未甲(jia)(jia)基(ji)(ji)(ji)(ji)(ji)(ji)化(hua)的(de) C 堿(jian)基(ji)(ji)(ji)(ji)(ji)(ji)轉化(hua)為(wei) U 堿(jian)基(ji)(ji)(ji)(ji)(ji)(ji),而甲(jia)(jia)基(ji)(ji)(ji)(ji)(ji)(ji)化(hua)的(de) C 則不會改變,進(jin)(jin)行 PCR擴增后 U 堿(jian)基(ji)(ji)(ji)(ji)(ji)(ji)會變成 T,與(yu)(yu)原本具有甲(jia)(jia)基(ji)(ji)(ji)(ji)(ji)(ji)化(hua)修飾的(de) C 堿(jian)基(ji)(ji)(ji)(ji)(ji)(ji)區分開來。 WGBS 精密度高(gao),可以得到單(dan)個(ge)堿(jian)基(ji)(ji)(ji)(ji)(ji)(ji),獲得單(dan)堿(jian)基(ji)(ji)(ji)(ji)(ji)(ji)精度生物(wu)甲(jia)(jia)基(ji)(ji)(ji)(ji)(ji)(ji)化(hua)圖譜。建議設(she)置 3-6 個(ge)生物(wu)學重(zhong)復,以減(jian)少組(zu)(zu)內誤差并增強結果的(de)可靠(kao)性。