CircRNA(Circular RNA),是一類不具有 5' 末端帽(mao)子和 3' 末(mo)端 poly(A)尾巴、并(bing)以共價鍵形成穩定閉合環狀結構的(de)非(fei)編碼(ma) RNA 分子。 CircRNA 廣泛存在于(yu)生物細胞(bao)中,對 miRNA 起重要(yao)的(de)調控作用,進而調控基因表達。隨著高通(tong)量測序技術的(de)發展(zhan), CircRNA 在多種真核(he)生物(wu)體內被大量鑒(jian)定出來(lai),利(li)用高通量測序技術,對(dui)生物(wu)樣(yang)本中的CircRNA 進(jin)行鑒定、表達豐度檢測(ce)及結(jie)構分(fen)析(xi),是(shi) RNA 領域的研(yan)究(jiu)熱點(dian),推動更深入的基因表達研(yan)究(jiu)。
CircRNA 實驗設計思(si)路(lu)為(wei)差異比較,常見的類型為(wei)實驗組(zu)與對照(zhao)組(zu)(case VS control),進(jin)行兩兩比(bi)較;若考慮時空因素,如按(an)照(zhao)不同生(sheng)長發(fa)育階段或者疾病(bing)發(fa)生(sheng)發(fa)展整個(ge)過程(cheng)進(jin)行比(bi)較,即進(jin)行多(duo)重比(bi)較分析,然后對差異的CircRNA 來源(yuan)基因進行預測和富集分(fen)析。一(yi)組(zu)樣品建議至少 6 個生(sheng)物學重(zhong)復。