染色質免疫共沉(chen)淀技(ji)術（Chromatin Immunoprecipitation，ChIP）也稱結合位(wei)(wei)點(dian)分析法，是研(yan)究體內蛋(dan)白質與(yu)DNA 相(xiang)互作(zuo)(zuo)用的(de)(de)有力(li)工具，通(tong)常用于(yu)轉錄(lu)因(yin)子結合位(wei)(wei)點(dian)或組蛋(dan)白特異(yi)性(xing)修飾位(wei)(wei)點(dian)的(de)(de)研(yan)究。將ChIP 與(yu)二(er)代測(ce)序技(ji)術相(xiang)結合的(de)(de)ChIP-Seq 技(ji)術，能夠檢測(ce)全基因(yin)組范圍(wei)內與(yu)組蛋(dan)白、轉錄(lu)因(yin)子等(deng)互作(zuo)(zuo)的(de)(de)DNA區(qu)段。
ChIP-Seq 的(de)原理是：首先(xian)通過(guo)染(ran)色質(zhi)免疫共沉淀技術（ChIP）特異性(xing)地富(fu)集目(mu)的(de)蛋白(bai)結合的(de)DNA 片段，并對其進行純(chun)化與文庫構建；然(ran)后對富(fu)集得到的(de)DNA片段進行高通量測序(xu)。研(yan)究人員通過(guo)將獲(huo)得的(de)序(xu)列標(biao)簽定位到基因組上，從(cong)而(er)獲(huo)得全(quan)基因組范圍內與組蛋白(bai)、轉錄因子等互(hu)作的(de)DNA 區段信息。
Ilumina HiSeq2000、 Ion Proton
1. 原始數據整理、過濾及質量評估
2. ChIP-Seq序列與參考基因組序列的比對
3. Peak Calling（統計每個樣品的Peak片段信息）
4. Peak Annotation（根據已有的基因組數據庫注釋信息獲得Peak位點信息）
5. Motif預測、基因集分析
6. 全基因組范圍的峰值分布
7. 樣品間差異Peak分析
8. 基因組水平和感興趣區域的數據可視化
1.根據實際需求可個性化(hua)定制測(ce)序及(ji)分(fen)析(xi)方案。
2.嚴謹(jin)的實驗(yan)流程和(he)檢測結果，數據分析結果可信。
3.分析結果的圖表參考(kao)國際期刊設計(ji)，可直接用(yong)于文章寫(xie)作。
4.與轉錄組(zu)等(deng)數據進行聯合分析，挖掘生物信息資源。
