1.ATAC-seq是否適合您?
ATAC能(neng)回答(da)以(yi)下三個問題:
①找調控(kong)某一生物學過(guo)程的(de)關鍵轉錄因(yin)子
②找哪個(ge)轉錄因子調(diao)控了我感興趣的(de)基因
③找我(wo)感興趣的轉錄因子調控的靶基因
2.ATAC-seq與ChIP-seq異同點?
1.ATAC-Seq是在(zai)全基因(yin)組范(fan)圍內檢測(ce)染(ran)色質(zhi)的開放區域,可以得到蛋白質(zhi)的潛在(zai)結合位點,不依賴于(yu)抗體,一般用于(yu)不知道特定(ding)的轉錄因(yin)子(zi)。
2.ChIP-Seq是明(ming)確(que)知(zhi)道感(gan)興趣的轉錄因(yin)子(zi)是什么,利用(yong)(yong)特異(yi)性抗(kang)體(ti)富集蛋(dan)(dan)白質及(ji)其結合的DNA片段,從而驗證蛋(dan)(dan)白質與DNA的相互作用(yong)(yong)關系。