Input是什(shen)么，有什(shen)么作用
input是指樣(yang)本(ben)經過超聲(sheng)，但是沒有進(jin)行(xing)(xing)ChIP，包含(han)樣(yang)本(ben)超聲(sheng)后總DNA，可以進(jin)行(xing)(xing)電泳，檢測超聲(sheng)效(xiao)果，同(tong)時，可以與最后ChIP樣(yang)本(ben)進(jin)行(xing)(xing)比較，看ChIP的(de)(de)(de)效(xiao)率（如果用(yong)同(tong)一(yi)引物進(jin)行(xing)(xing)PCR，ChIP組和input組亮度差不多，說(shuo)明(ming)ChIP效(xiao)率高(gao)，基本(ben)上，樣(yang)本(ben)中所有的(de)(de)(de)目(mu)的(de)(de)(de)基因片段(duan)都被ChIP下來了，反之(zhi)，說(shuo)明(ming)效(xiao)率低，實驗(yan)條件有待改進(jin)）
ChIP-seq測序(xu)需要(yao)多少數據量(liang)？
推薦20M reads /樣本的數據量。
文庫制備過程是否需要PCR 擴(kuo)增？PCR 擴(kuo)增后(hou)是否會影響最(zui)后(hou)的結(jie)果(guo)？
基于二代測(ce)序平臺的ChIP-Seq在文庫(ku)制備過程中需要(yao)進行(xing)PCR，主(zhu)要(yao)是為了獲得足(zu)夠(gou)上機反應(ying)的DNA量，如果提供的DNA樣品足(zu)量，可減少PCR循環數。因此由(you)PCR引(yin)起的偏向(xiang)性小。
