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科研服務

CircRNA測序

常見問題

  • 為什么CircRNA測序的研究比較熱?

    1)多角度(du)闡述分子生(sheng)物學問題的需(xu)要;

    2)從(cong)新(xin)的角度(du)發現導致樣本存(cun)在差(cha)異的需要;

    3)尋找影響疾病發生的分(fen)子標記;

    4)探究circRNA的未知功能;

    5)尋找導致microRNA表達發生變化的機理(li)。

  • CircRNA測序需要多少數據量?

    推薦10G clean data/樣本(ben)的數據量。

  • CircRNA測序的(de)條件(jian)?

    1. 有參考基因組,并(bing)且有CircRNA注釋信息;

    2. 有相應(ying)的核糖(tang)體去(qu)除試劑盒。

  • CircRNA有哪些特點?

    1. 大多(duo)存(cun)在(zai)于(yu)細胞質中(zhong),且序列高度(du)保守;

    2. 一(yi)般細胞或組織中(zhong),環狀(zhuang)RNA較穩定,半衰(shuai)期在48h,其他mRNA(線(xian)性)半衰(shuai)期約(yue)為(wei)10h;血清中(zhong)的外(wai)顯子環狀(zhuang)RNA不穩定,半衰(shuai)期<15s。

    3. 不(bu)(bu)同細胞中表達(da)的環狀(zhuang)RNA可能不(bu)(bu)同;

    4. 同一個(ge)基因可(ke)(ke)能即產生線(xian)性mRNA,又可(ke)(ke)以轉(zhuan)錄成環(huan)狀(zhuang)RNA;

    5. 總量估計,外顯子環狀RNA(exonic ciRcRNA)的量約(yue)為(wei)polyA mRNA(線性mRNA)的1%;占非核糖(tang)體(ti)RNA的0.8%;

    6. 大部(bu)分為ncRNA。