2024-03-19
近(jin)日，農(nong)業農(nong)村部印發(fa)(fa)公告，發(fa)(fa)布(bu)了(le)(le)(le)國(guo)(guo)家畜(chu)(chu)(chu)(chu)禽(qin)(qin)遺(yi)(yi)傳資源委員會審(shen)定(ding)(ding)鑒定(ding)(ding)通(tong)過(guo)的(de)(de)一批(pi)畜(chu)(chu)(chu)(chu)禽(qin)(qin)、蠶新(xin)(xin)(xin)品種配(pei)套系(xi)(xi)和新(xin)(xin)(xin)發(fa)(fa)現畜(chu)(chu)(chu)(chu)禽(qin)(qin)、蜂(feng)遺(yi)(yi)傳資源。審(shen)定(ding)(ding)通(tong)過(guo)新(xin)(xin)(xin)品種配(pei)套系(xi)(xi)21個，鑒定(ding)(ding)通(tong)過(guo)畜(chu)(chu)(chu)(chu)禽(qin)(qin)、蜂(feng)遺(yi)(yi)傳資源17個，突出了(le)(le)(le)品質(zhi)改良、生(sheng)(sheng)產性(xing)能(neng)提升及環境適應性(xing)培育(yu)等方向(xiang)。與(yu)此同時，2024年(nian)(nian)國(guo)(guo)自然申(shen)請即將落下帷幕(mu)。2023年(nian)(nian)與(yu)2024年(nian)(nian)國(guo)(guo)自然生(sheng)(sheng)命科學部設立的(de)(de)重點(dian)項(xiang)(xiang)目立項(xiang)(xiang)領(ling)域(yu)在畜(chu)(chu)(chu)(chu)禽(qin)(qin)方面(mian)基(ji)本沒有變(bian)化。涵蓋“畜(chu)(chu)(chu)(chu)禽(qin)(qin)、蜂(feng)蠶重要性(xing)狀的(de)(de)形(xing)成與(yu)調控機制（C17）”、“畜(chu)(chu)(chu)(chu)禽(qin)(qin)飼(si)料(liao)養分(fen)高效利用與(yu)新(xin)(xin)(xin)型飼(si)料(liao)資源挖掘的(de)(de)生(sheng)(sheng)物(wu)學基(ji)礎(chu)(chu)（C17）”、“畜(chu)(chu)(chu)(chu)禽(qin)(qin)重要疫病與(yu)人獸共患病病原致病、免疫與(yu)耐藥（C18）”和“畜(chu)(chu)(chu)(chu)禽(qin)(qin)重要疾病的(de)(de)病理/生(sheng)(sheng)理學基(ji)礎(chu)(chu)與(yu)宿主響(xiang)應（C18）”。結合文獻報道與(yu)2023年(nian)(nian)部分(fen)國(guo)(guo)自然中標項(xiang)(xiang)目情況（表1），小派為大家整理了(le)(le)(le)畜(chu)(chu)(chu)(chu)禽(qin)(qin)動物(wu)多組學研究的(de)(de)熱(re)點(dian)方向(xiang)：
畜(chu)禽遺傳資源的(de)保護(hu)與利用(yong)
研究如何(he)有(you)效保護珍(zhen)稀和特有(you)的畜禽遺傳資源，通過基因組學等技術進(jin)行種質創新、品種改良及高效開發利用。
畜(chu)禽(qin)重要性狀形成的多組(zu)學(xue)機制解(jie)析
通過整合基因組、轉錄(lu)組、蛋(dan)白組等多種組學數據，研究畜禽(qin)生(sheng)長發育(yu)、肉質、抗病性(xing)(xing)等重要經(jing)濟性(xing)(xing)狀的(de)遺傳基礎及(ji)其調控網(wang)絡(luo)。
畜禽飼(si)料養(yang)分高效利(li)用的多組學研究
運用(yong)多組學技(ji)術探索畜禽對飼(si)料(liao)養(yang)分吸收、轉(zhuan)化與利用(yong)的生物學機制，以及新型(xing)飼(si)料(liao)資源的潛在營養(yang)價值挖掘。
畜禽疫(yi)病與人獸共患病病原致病與免疫(yi)耐藥的多組(zu)學(xue)分析
結合基因組(zu)(zu)學、轉錄(lu)組(zu)(zu)學、代謝(xie)組(zu)(zu)學等手段，深入(ru)理解畜(chu)禽疫(yi)病(bing)病(bing)原體的感染機制(zhi)、宿(su)主免疫(yi)反應及其耐藥性(xing)演變規律。
畜禽重要疾病的病理生理學與宿主響應的多組學探討
利用多組學(xue)策略，揭示畜禽重要疾(ji)病發(fa)生(sheng)發(fa)展的分子(zi)機制、病理生(sheng)理變化以及(ji)機體(ti)對此類疾(ji)病的應答模式。
綠色健康養殖技術
探索減少抗生素使用(yong)、提高動物(wu)福利的(de)新型飼(si)(si)養模式和技術，包括微(wei)(wei)生物(wu)調控、飼(si)(si)料(liao)添加劑的(de)研發、精準營養供給以及環境友好型養殖設施的(de)建設等。
動物腸道微(wei)生物與健康
深入研究畜(chu)(chu)禽(qin)腸(chang)道微生物群落結構與功能(neng)(neng)(neng)及其與宿(su)主健康(kang)（如生長性能(neng)(neng)(neng)、免疫(yi)機能(neng)(neng)(neng)、疾(ji)病抵抗(kang)能(neng)(neng)(neng)力）的(de)關系，以期通過調控(kong)腸(chang)道微生態來改善畜(chu)(chu)禽(qin)健康(kang)狀況和生產性能(neng)(neng)(neng)。
表1 2023年畜(chu)禽(qin)動物多組學研究相關國自(zi)然部分中(zhong)標(biao)項目(mu)
資(zi)助類型 | 項目(mu)名稱 |
面(mian)上(shang)項目(mu) | 新麥草飼草品(pin)質性狀的全基因組關聯分析及(ji)候(hou)選基因挖掘 |
面上項目 | 豬流行性腹瀉(xie)病毒感染(ran)(ran)關鍵宿主因(yin)子(zi)的篩選及影響(xiang)病毒感染(ran)(ran)分子(zi)機(ji)制研究(jiu) |
面上項目 | 基于(yu)益(yi)生(sheng)活性的豬結腸(chang)菌群(qun)對阿拉伯(bo)木聚糖的動態響應機(ji)制研究 |
面上項目 | 基于(yu)多類(lei)遺傳變(bian)異(yi)的(de)豬基因組選擇(ze)方法研究 |
面上項目 | 基于單(dan)細(xi)胞測序技術解(jie)析雞卵母細(xi)胞篩選與原始卵泡形成(cheng)的調控機制 |
面上項目 | 畜禽糞污厭氧(yang)發(fa)酵休眠病原菌(jun)深度滅活(huo)機理與靶(ba)向環境(jing)調控 |
面上項目 | 再生(sheng)水(shui)與畜(chu)禽糞(fen)肥農田灌溉抗(kang)生(sheng)素耐藥(yao)菌群(qun)落融(rong)合與傳播機制 |
青年科學基金項目 | 共生微(wei)生物對豬小(xiao)腸黏膜免疫的分子(zi)調控機(ji)制研究 |
青年(nian)科學基金項目(mu) | 瘤胃微生(sheng)物與宿主(zhu)互作介導丙酮酸(suan)肌酸(suan)促進新進牛生(sheng)長的機(ji)制研究 |
青年科學基金(jin)項(xiang)目 | 基于(yu)多組學(xue)解析(xi)鴨腸(chang)道菌群影響生長性狀(zhuang)的(de)分子機(ji)制 |
青年(nian)科(ke)學基金項目 | 基(ji)于多(duo)組學數(shu)據鑒定調控(kong)北京(jing)鴨胸(xiong)肌快速發育的核心基(ji)因及(ji)遺傳(chuan)變異(yi) |
地區科學基金(jin)項目 | 環(huan)青海湖地(di)區水源(yuan)-螺-畜(chu)群(qun)間吸蟲(chong)種群(qun)遺傳進化(hua)分析及感染風(feng)險評估 |
地(di)區科學基金項目 | 畜(chu)禽糞(fen)肥還田(tian)利用的(de)種植戶行(xing)為響應：驅(qu)動機(ji)理、激勵機(ji)制與政(zheng)策仿(fang)真 |
派(pai)森諾(nuo)畜禽(qin)領域部分(fen)案例 雉(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)雞(ji)（Phasianus Colchicus），也(ye)被稱為(wei)環頸雉(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)雞(ji)，是(shi)一種(zhong)原產(chan)于亞(ya)(ya)洲的一種(zhong)雀形目、雀形科（Phasianidae）的鳥類，已被廣泛引入(ru)歐(ou)洲、美洲和(he)澳大(da)利(li)亞(ya)(ya)。根據它們(men)的形態變化分類，雉(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)雞(ji)多(duo)達(da)30個亞(ya)(ya)種(zhong)，分布于世界(jie)各地，能夠適(shi)應不(bu)同的棲息地。雉(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)雞(ji)的圈養歷史較長，但馴(xun)化歷史相對較短。中(zhong)國環頸雉(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)雞(ji)多(duo)數(shu)為(wei)雉(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)雞(ji)亞(ya)(ya)種(zhong)的后代。隨著國內市(shi)場需(xu)求量的增加，商品(pin)化的雉(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)雞(ji)已成(cheng)為(wei)消費較多(duo)的珍稀家禽和(he)優質蛋白(bai)質的重(zhong)要來源(yuan)。然而，與(yu)雞(ji)和(he)鴨等完全家養的家禽不(bu)同，養殖的雉(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)雞(ji)的遺傳改良(liang)是(shi)當務之急。本研(yan)究組裝了(le)雉(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)雞(ji)染色體水(shui)平基因(yin)組，發現在一系列鈣相關(guan)基因(yin)中(zhong)發生(sheng)了(le)拷貝(bei)數(shu)改變和(he)特異性正選(xuan)擇，這在雉(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)雞(ji)的適(shi)應性進(jin)化中(zhong)起著重(zhong)要作用，并對國內雉(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)雞(ji)品(pin)種(zhong)進(jin)行了(le)基因(yin)組重(zhong)測(ce)序(xu)群體遺傳學分析，找到了(le)與(yu)家養雉(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)雞(ji)體重(zhong)相關(guan)的人工選(xuan)擇區域(yu)，揭(jie)示了(le)生(sheng)產(chan)性狀的人工選(xuan)擇信號。 研究技(ji)術路線圖和結果(guo)展示(shi) 營養與(yu)動物的(de)(de)免(mian)疫(yi)(yi)與(yu)健康息息相關，母(mu)體(ti)的(de)(de)免(mian)疫(yi)(yi)將(jiang)助(zhu)益(yi)她們的(de)(de)后代(dai)(dai)。前(qian)期(qi)(qi)研究(jiu)發(fa)(fa)現(xian)，對母(mu)雞(ji)(ji)進(jin)(jin)行營養干(gan)預出(chu)現(xian)了“母(mu)強子(zi)壯”的(de)(de)母(mu)體(ti)效(xiao)應現(xian)象。然而，母(mu)體(ti)的(de)(de)免(mian)疫(yi)(yi)優勢是(shi)如何傳遞與(yu)助(zhu)益(yi)她們的(de)(de)后代(dai)(dai)呢？本(ben)(ben)研究(jiu)通過收集母(mu)雞(ji)(ji)輸卵(luan)管(guan)刮片樣(yang)(yang)本(ben)(ben)、蛋(dan)清樣(yang)(yang)本(ben)(ben)、雞(ji)(ji)胚(pei)盲腸(chang)樣(yang)(yang)本(ben)(ben)，對母(mu)雞(ji)(ji)膨大(da)部-蛋(dan)清-胚(pei)胎(tai)腸(chang)道(dao)進(jin)(jin)行菌(jun)落多樣(yang)(yang)性解析、收集雞(ji)(ji)胚(pei)腸(chang)道(dao)樣(yang)(yang)本(ben)(ben)進(jin)(jin)行轉錄(lu)組測序(xu)等(deng)方式，發(fa)(fa)現(xian)禽類腸(chang)道(dao)在(zai)(zai)胚(pei)胎(tai)期(qi)(qi)便開始(shi)與(yu)微(wei)(wei)(wei)生(sheng)物接觸，這(zhe)些(xie)微(wei)(wei)(wei)生(sheng)物大(da)多數(shu)溯源于母(mu)體(ti)生(sheng)殖(zhi)道(dao)，并且自胚(pei)胎(tai)期(qi)(qi)便影響著腸(chang)道(dao)的(de)(de)基(ji)因(yin)(yin)表達與(yu)發(fa)(fa)育(yu)。該項(xiang)研究(jiu)討論并認識了母(mu)體(ti)免(mian)疫(yi)(yi)因(yin)(yin)子(zi)與(yu)生(sheng)殖(zhi)系統微(wei)(wei)(wei)生(sheng)物對后代(dai)(dai)發(fa)(fa)育(yu)的(de)(de)重要(yao)性，提出(chu)了生(sheng)殖(zhi)系統微(wei)(wei)(wei)生(sheng)物是(shi)改善動物健康的(de)(de)潛在(zai)(zai)資源的(de)(de)新觀點，啟發(fa)(fa)了禽類健康養殖(zhi)新的(de)(de)研究(jiu)方向。 研(yan)究(jiu)技(ji)術路線圖(tu)和結果(guo)展示 眾(zhong)所周知，腸(chang)(chang)(chang)(chang)道(dao)微(wei)生物(wu)(wu)(wu)組(zu)對(dui)維(wei)持宿(su)主(zhu)(zhu)健康和提升動物(wu)(wu)(wu)生產性(xing)能(neng)發(fa)揮著重要作(zuo)用，但它的(de)(de)相對(dui)貢(gong)獻很難度(du)(du)量(liang)，特別是(shi)在(zai)(zai)(zai)考慮宿(su)主(zhu)(zhu)自身遺(yi)傳(chuan)效應的(de)(de)前提之下。本(ben)研究(jiu)以(yi)(yi)雞為(wei)動物(wu)(wu)(wu)模型(xing)，對(dui)206只肉(rou)雞進行宿(su)主(zhu)(zhu)基因組(zu)重測序，并對(dui)其十二指(zhi)腸(chang)(chang)(chang)(chang)、空腸(chang)(chang)(chang)(chang)、回腸(chang)(chang)(chang)(chang)、盲腸(chang)(chang)(chang)(chang)及(ji)糞便微(wei)生物(wu)(wu)(wu)組(zu)進行16S rRNA基因V4區(qu)測序，以(yi)(yi)評估腸(chang)(chang)(chang)(chang)道(dao)菌群的(de)(de)組(zu)成(cheng)(cheng)結構變化。本(ben)研究(jiu)發(fa)現，腸(chang)(chang)(chang)(chang)道(dao)菌群對(dui)特定腸(chang)(chang)(chang)(chang)段(duan)的(de)(de)微(wei)環境具有高度(du)(du)適(shi)應性(xing)，不同(tong)腸(chang)(chang)(chang)(chang)道(dao)部位(wei)的(de)(de)菌群在(zai)(zai)(zai)多樣性(xing)、組(zu)成(cheng)(cheng)和功(gong)能(neng)潛力方(fang)面都存在(zai)(zai)(zai)差異。雖然各腸(chang)(chang)(chang)(chang)段(duan)微(wei)生物(wu)(wu)(wu)組(zu)在(zai)(zai)(zai)組(zu)成(cheng)(cheng)及(ji)潛在(zai)(zai)(zai)功(gong)能(neng)上存在(zai)(zai)(zai)較大(da)不同(tong)，但在(zai)(zai)(zai)評估各腸(chang)(chang)(chang)(chang)段(duan)微(wei)生物(wu)(wu)(wu)的(de)(de)整體(ti)遺(yi)傳(chuan)性(xing)后，發(fa)現宿(su)主(zhu)(zhu)遺(yi)傳(chuan)對(dui)腸(chang)(chang)(chang)(chang)道(dao)微(wei)生物(wu)(wu)(wu)的(de)(de)塑造作(zuo)用很小。 研(yan)究(jiu)技術路線圖和結果展示
