2024-03-27
在醫學(xue)的(de)廣闊(kuo)領(ling)域中(zhong)，肝(gan)癌一(yi)直是我(wo)們面臨(lin)的(de)一(yi)大挑(tiao)戰。在多組(zu)學(xue)分析(xi)的(de)助(zhu)力下，人(ren)們逐漸揭開(kai)了(le)其神秘(mi)面紗，開(kai)啟了(le)全新的(de)研究視角。
全(quan)基(ji)因組(zu)測序讓我們窺見了(le)肝癌基(ji)因的(de)(de)變異圖譜，轉錄組(zu)和蛋白質組(zu)學(xue)則揭(jie)示(shi)了(le)癌細胞(bao)內(nei)復雜的(de)(de)分子交互網絡，以及微生物與(yu)肝癌之間存在(zai)著的(de)(de)微妙關(guan)系(xi)。通過這些多組(zu)學(xue)數據(ju)的(de)(de)整(zheng)合分析(xi)，不僅(jin)描繪出肝癌的(de)(de)全(quan)方位畫像，更為我們提供了(le)精(jing)準(zhun)治(zhi)(zhi)療(liao)的(de)(de)新思(si)路。今天，我們將帶您走進這個(ge)充(chong)滿奧秘的(de)(de)世界(jie)，一起(qi)探索(suo)多組(zu)學(xue)分析(xi)如何助力肝癌的(de)(de)研究，為未(wei)來的(de)(de)精(jing)準(zhun)治(zhi)(zhi)療(liao)提供有(you)力支持！
一、通路揭秘 題目：USP22 regulates lipidome accumulation by stabilizing PPARγ in hepatocellular carcinoma USP22通過(guo)穩定(ding)肝(gan)細胞癌(ai)中的PPARγ調(diao)節脂質組積累(lei) 期刊：Nature Communications 影響因子：16.6 背景(jing) 肝(gan)臟是(shi)糖(tang)、脂質(zhi)和(he)蛋白質(zhi)代(dai)(dai)謝的關(guan)鍵器官。包(bao)括(kuo)肝(gan)細胞癌（HCC）在(zai)內的各種肝(gan)臟疾(ji)(ji)病都與代(dai)(dai)謝異常有關(guan)。全球(qiu)肝(gan)癌發病率正在(zai)迅速增加，部分(fen)原因(yin)(yin)是(shi)肥胖癥的流行以及隨后代(dai)(dai)謝相關(guan)脂肪肝(gan)（MAFLD）的發展(zhan)。目前科學家(jia)們清(qing)(qing)楚(chu)地(di)定義了HCC中(zhong)基因(yin)(yin)改變(bian)的格(ge)局。然而，這一系列疾(ji)(ji)病過(guo)程的分(fen)子機制尚不清(qing)(qing)楚(chu)。 組學技術 轉錄組、代謝(xie)組學、脂質組學、IP-MS 其他技術(shu) 免疫組織(zhi)(zhi)化學(xue)、異種移植(zhi)腫瘤模型、免疫沉淀(dian)、pull down、去泛素(su)化試驗、熒(ying)光素(su)酶檢測、組織(zhi)(zhi)學(xue)、免疫熒(ying)光、chip 技術(shu)路線 結果(guo) 結論(lun) 我(wo)們(men)(men)發(fa)現USP22是(shi)新生(sheng)(sheng)脂(zhi)肪(fang)酸(suan)(suan)合成(cheng)的(de)關(guan)鍵調(diao)節因子。它直接與去泛(fan)素化相(xiang)互作(zuo)用，并(bing)通過K48連接的(de)去泛(fan)素化穩定PPARγ，進而(er)這種(zhong)穩定增(zeng)加了(le)ACC和ACLY的(de)表達。此(ci)外(wai)，我(wo)們(men)(men)發(fa)現USP22能夠促(cu)進新生(sheng)(sheng)脂(zhi)肪(fang)酸(suan)(suan)合成(cheng)和HCC的(de)腫(zhong)瘤發(fa)生(sheng)(sheng)。然而(er)在(zai)體(ti)內腫(zhong)瘤發(fa)生(sheng)(sheng)實驗(yan)中(zhong)，通過抑制(zhi)(zhi)PPARγ、ACLY或(huo)ACC的(de)表達，可以抑制(zhi)(zhi)這種(zhong)致(zhi)癌(ai)性。在(zai)HCC中(zhong)，USP22的(de)高表達與PPARγ、ACLY或(huo)ACC的(de)表達呈(cheng)正相(xiang)關(guan)，并(bing)與不良預后相(xiang)關(guan)。綜上所述，我(wo)們(men)(men)確(que)定了(le)USP22調(diao)控的(de)脂(zhi)肪(fang)生(sheng)(sheng)成(cheng)機(ji)制(zhi)(zhi)，該機(ji)制(zhi)(zhi)涉及HCC發(fa)生(sheng)(sheng)中(zhong)的(de)PPARγ-ACLY/ACC軸，并(bing)為通過抑制(zhi)(zhi)USP22靶向(xiang)脂(zhi)肪(fang)生(sheng)(sheng)成(cheng)的(de)治療提(ti)供(gong)了(le)理論依據。
二、精(jing)準治療 題(ti)目：Integrated multiomic analysis reveals comprehensive tumour heterogeneity and novel immunophenotypic classification in hepatocellular carcinomas 綜合(he)多組(zu)學分析揭示了肝細胞癌的(de)(de)綜合(he)腫瘤異質性和新的(de)(de)免疫表型分類 期刊：HEPATOLOGY 影響(xiang)因子：13.5 背景 肝細胞癌(HCC)具有(you)(you)異(yi)(yi)質(zhi)性，尤其是多灶(zao)性腫瘤，這降低了臨床治(zhi)療(liao)的(de)(de)療(liao)效。了解(jie)腫瘤的(de)(de)異(yi)(yi)質(zhi)性是制定新的(de)(de)治(zhi)療(liao)策略的(de)(de)關(guan)鍵(jian)。然(ran)而，缺乏對HCC中腫瘤異(yi)(yi)質(zhi)性的(de)(de)全面調查，并(bing)且關(guan)于腫瘤異(yi)(yi)質(zhi)性的(de)(de)現有(you)(you)證據并(bing)未導(dao)致臨床實踐的(de)(de)改善。 組(zu)學技術 全(quan)外顯子(zi)組(zu)測序、轉錄組(zu)、蛋(dan)白質組(zu)學(xue)、非(fei)靶向代謝組(zu)學(xue) 其他技術 形(xing)態學、JAC card評分、CyTOF 技術路(lu)線(xian) 結(jie)果 結論 使(shi)用全外顯(xian)(xian)子(zi)(zi)組(zu)測(ce)序、RNA測(ce)序、蛋白質組(zu)學和(he)(he)(he)代(dai)謝組(zu)學以(yi)及質譜細(xi)胞(bao)計量技術(shu)，我們(men)證明了腫瘤細(xi)胞(bao)在所有(you)(you)維(wei)度上的(de)(de)(de)顯(xian)(xian)著異質性。發現局部(bu)免疫(yi)是HCC治療的(de)(de)(de)合適靶點，并確(que)定了三種(zhong)HCC亞型，它們(men)在免疫(yi)狀(zhuang)態(tai)、趨化(hua)因子(zi)(zi)/細(xi)胞(bao)因子(zi)(zi)和(he)(he)(he)細(xi)胞(bao)代(dai)謝方面具有(you)(you)獨特的(de)(de)(de)腫瘤微環境。腫瘤細(xi)胞(bao)的(de)(de)(de)PI3K-Akt信號和(he)(he)(he)酮體(ti)代(dai)謝與HCC微環境中的(de)(de)(de)CD8+ T細(xi)胞(bao)浸潤(run)相關。新的(de)(de)(de)免疫(yi)表型分(fen)類可以(yi)簡單地使(shi)用免疫(yi)組(zu)織化(hua)學通(tong)過測(ce)試(shi)具有(you)(you)明確(que)截(jie)止(zhi)值的(de)(de)(de)兩種(zhong)標(biao)志物（CD45和(he)(he)(he)Foxp3）來概括，顯(xian)(xian)示(shi)出(chu)預(yu)后預(yu)測(ce)和(he)(he)(he)治療選擇決策指(zhi)導的(de)(de)(de)價值。
派森諾生物(wu)合作客戶在微生物(wu)-腫瘤領域發(fa)表的部分文(wen)章
喜迎開學季，醫口(kou)多組學聯合(he)分析(xi)免費送 派(pai)森諾生物(wu)作為國內早期(qi)涉足微(wei)生物(wu)多樣性(xing)測(ce)序(xu)的(de)高(gao)通(tong)量測(ce)序(xu)公(gong)司，在微(wei)生物(wu)-器官(guan)軸(zhou)領域積(ji)累了(le)(le)豐富的(de)項目經驗。通(tong)過整合宏基因組(zu)學、微(wei)生物(wu)多樣性(xing)組(zu)成譜測(ce)序(xu)、代謝組(zu)學、轉錄組(zu)學等多組(zu)學方法，我(wo)們建立了(le)(le)全面(mian)的(de)實驗平臺和(he)數據(ju)分(fen)(fen)析體系，提(ti)供從(cong)樣本準(zhun)備到文章發表的(de)全方位服務(wu)。我(wo)們的(de)多組(zu)學聯合分(fen)(fen)析手段，如關聯熱(re)圖(tu)、網絡圖(tu)分(fen)(fen)析、Mantel檢(jian)驗和(he)Procrustes分(fen)(fen)析等，能夠(gou)深入挖掘(jue)微(wei)生物(wu)與器官(guan)軸(zhou)之間(jian)的(de)功能機(ji)制，為研(yan)究微(wei)生物(wu)-器官(guan)軸(zhou)研(yan)究提(ti)供堅實的(de)支持。
