2024-04-07
派森(sen)諾基因(yin)云，新推出的轉錄組(zu)2.0分(fen)(fen)析系統，在原有系統上實現(xian)重大升級：首先，優化了(le)一鍵式(shi)分(fen)(fen)析流(liu)程，升級為(wei)數(shu)(shu)據(ju)(ju)(ju)集創(chuang)建形式(shi)，簡化操(cao)作(zuo)，提高(gao)效率，且新增數(shu)(shu)據(ju)(ju)(ju)集管(guan)理(li)(li)功能；其次(ci)，積(ji)極響(xiang)應用戶需求，添加了(le)樣本(ben)重命名功能，增強(qiang)數(shu)(shu)據(ju)(ju)(ju)管(guan)理(li)(li)的靈活性；此外，還(huan)強(qiang)化了(le)數(shu)(shu)據(ju)(ju)(ju)篩(shai)選(xuan)過濾功能，支持按多(duo)維度精確(que)篩(shai)選(xuan)轉錄組(zu)數(shu)(shu)據(ju)(ju)(ju)，提升轉錄組(zu)數(shu)(shu)據(ju)(ju)(ju)分(fen)(fen)析的便捷性和(he)準確(que)性。一起來看看這些強(qiang)大的功能如何操(cao)作(zuo)吧(ba)~ 一、數據集創(chuang)建(jian) 支持自(zi)定義創建數(shu)據集(ji)，選擇需要分析的章節，配(pei)置(zhi)參數(shu)后(hou)一鍵提交分析。如果需要進(jin)一步對(dui)(dui)數(shu)據集(ji)每個章節結(jie)果進(jin)行調整(zheng)，可(ke)在對(dui)(dui)應章節頁(ye)面切(qie)換數(shu)據集(ji)查看(kan)修改。 二、樣本重命名 新增樣本(ben)(ben)重命名(ming)功(gong)能，方便用(yong)戶修改(gai)和管(guan)理樣本(ben)(ben)。通過切換不(bu)同的樣本(ben)(ben)方案名(ming)稱(cheng)，快速實(shi)現樣本(ben)(ben)名(ming)稱(cheng)的更換。
三、數(shu)據篩選 3.1、火山圖的標注基(ji)因 基(ji)因(yin)標注有三種篩(shai)選(xuan)(xuan)方式：分(fen)區篩(shai)選(xuan)(xuan)、總體篩(shai)選(xuan)(xuan)以及自定義篩(shai)選(xuan)(xuan)。 1. 分區篩選(xuan) 對up（上調）和down（下調），分別篩選過濾出topn的基因。 2. 總體篩選 不區分topn，整體(ti)篩(shai)選(xuan)出(chu)topn的基因。 3. 自定義篩選 自定義輸入感興趣的基因(yin)ID，在圖(tu)中進行標注。 3.2、聚(ju)類分析(xi)的基因標注 標簽(qian)內(nei)容(rong)可選擇(ze)任(ren)意一種(zhong)顯示：基因名稱(cheng)、基因ID、數據庫名稱(cheng)、以(yi)及(ji)自定義標簽(qian)名稱(cheng)。 3.3、GO富集分析的(de)Go term篩選 Go term篩選(xuan)也有三種方(fang)式進(jin)行選(xuan)擇：全(quan)部、分組、以及(ji)自(zi)定義。 全部：根據P值或adjustPvalue過(guo)濾排序(xu)后(hou)，選擇topn的Go term在圖(tu)表中顯(xian)示(shi)。 分(fen)組：分(fen)別對BP、MF、CC取topn的Go term進行展示。 自定(ding)義：自定(ding)義輸(shu)入Go term在圖中進(jin)行展示。 3.4、KEGG富集分析的KEGG Pathway篩選(xuan) 和go富集分析(xi)一樣，也提供(gong)3種KEGG Pathway篩選方式，分別是全部、level、以及(ji)自定義(yi)。
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