2024-05-29
在我們生活的(de)各個角落，都隱(yin)藏著(zhu)一個神(shen)秘而又龐(pang)大的(de)微觀世界，那里居住著(zhu)數(shu)以億萬計的(de)微生物(wu)。今(jin)天，跟著(zhu)小派一起踏上這場(chang)探索微生物(wu)組(zu)(zu)(zu)學奧秘的(de)旅(lv)(lv)程，從研(yan)究思路到(dao)實踐應用，全(quan)面解(jie)鎖微生物(wu)組(zu)(zu)(zu)學的(de)無限可能！無論您(nin)是初(chu)步接(jie)觸微生物(wu)組(zu)(zu)(zu)的(de)小白，還是已經略有建(jian)樹的(de)研(yan)究者，這趟(tang)旅(lv)(lv)程您(nin)一定(ding)會(hui)滿載而歸。干貨(huo)較多，記得收藏哦。 （ps：后續具體視頻及(ji)軟文(wen)內(nei)容點擊網站或超(chao)鏈接(jie)查看，紅色的(de)為派森諾云學院視頻，藍色的(de)為干貨軟文(wen)。視頻只需(xu)注(zhu)冊(ce)即可(ke)觀看喲）
第一站(zhan) 思路大派(pai)送-微生物組學的奇幻之旅啟程 歡迎小伙伴們(men)(men)踏入微(wei)(wei)生(sheng)物組(zu)學的神(shen)秘殿堂！是否還苦惱(nao)于什么(me)是微(wei)(wei)生(sheng)物組(zu)？怎么(me)去研(yan)究微(wei)(wei)生(sheng)物組(zu)？微(wei)(wei)生(sheng)物組(zu)的實驗該如何(he)設計嗎？首先(xian)，我們(men)(men)將(jiang)為大家(jia)帶來一(yi)系列(lie)精(jing)彩紛(fen)呈的思(si)路大放送。無(wu)論(lun)您是對微(wei)(wei)生(sheng)物組(zu)學充滿(man)好奇的新手，還是渴望(wang)深入探索的研(yan)究者，這里都(dou)將(jiang)有(you)您想要的答案。多維(wei)度的數據融合和(he)生(sheng)動的案例解讀將(jiang)轉化為一(yi)把把鑰匙(chi)，解鎖(suo)微(wei)(wei)生(sheng)物與健康、環境(jing)、農業間錯綜復雜(za)的關聯。讓(rang)我們(men)(men)共同踏上(shang)微(wei)(wei)生(sheng)物組(zu)學的奇妙(miao)之旅！ 1、以微生(sheng)物為中(zhong)心的多組學整(zheng)合研究 微(wei)生物組大(da)數據挖掘(jue)思路(lu)；全微(wei)生物組關聯(lian)分析(xi)MWAS；多組學整合研(yan)究的方法(fa)；多組學整合研(yan)究案例解讀 //www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/a3acffcb565643928c072d9de25a2fd9 2、一起(qi)聊(liao)聊(liao)微生物組研究(jiu)中的(de)多(duo)組學(xue)整合(he)思(si)路 多組學整合思路和案例(li)介紹 //www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/823b0c4fb5f94b799caeffced54034a5 3、多組學技術(shu)在中(zhong)醫藥(yao)研究領域的應用 中醫(yi)藥研究領域微生物組(zu)多(duo)組(zu)學思路(lu)歸納；多(duo)組(zu)學關聯的(de)常用分析方法；案例分享(xiang) //www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/0858cf4089e871ee80185107e0c90102 4、微生物組在醫學研(yan)究中(zhong)的(de)應用和(he)思路 微生物和(he)醫(yi)學(xue)研究的關系；思路和(he)分析方(fang)法；案例介紹 //www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/2d73d5d083b54889890acd8345095510
6、微(wei)(wei)生物組在農學研究中(zhong)的(de)應用(yong)和思路(lu)
微(wei)生(sheng)物和(he)(he)農學(xue)研(yan)究的關系；思路和(he)(he)分析方法；案例介紹
//www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/b8cc94c9b4574c63afe2a6e1b8f51f70
第二站 教(jiao)授開(kai)講(jiang)啦-微生(sheng)物組(zu)學名家(jia)講(jiang)座(zuo) 掌聲(sheng)有請我(wo)們的(de)專家教授！他(ta)們將帶您(nin)穿梭(suo)于微(wei)(wei)生物(wu)組學的(de)核(he)心領域，為我(wo)們揭示(shi)微(wei)(wei)生物(wu)組學的(de)深層奧(ao)秘。讓我(wo)們一同領略(lve)領略(lve)學術的(de)無窮(qiong)魅力，千萬不要(yao)錯過哦！ 1、陳廷濤教授微生(sheng)物組講座錄像：健康的破壞者與重建者 //www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/add9cdcfbe3e459c97af256ad806cd2b 2、沈友明(ming)博士微(wei)生(sheng)物組講座錄像(xiang):”守(shou)衛(wei)香甜”的蘋果(guo)表面(mian)微(wei)生(sheng)物初探 //www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/8501a9bfe590400099a77a84b4c4abb3 3、趙超教(jiao)授(shou)微生物組(zu)講座(zuo)視頻:從菌群組(zu)成分析到其后機制的橋梁 //www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/a16dffca8dfd4750b9ba336b422d324f 4、段勝(sheng)仲教授(shou)微生物講座視頻：口腔(qiang)-腸道微生物交流與高壓的因果關系 //www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/cf2e56872cf64488b89f38f9bfa46d58 5、孫蔚旻教授微生(sheng)物講座視(shi)頻(pin)：尾礦(kuang)極端環(huan)境(jing)下的(de)的(de)生(sheng)物地球化(hua)學過(guo)程及其環(huan)境(jing)調控 //www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/adc4e1671a9d49779f96b19c8655502a
第三站 結(jie)果解讀-揭開微觀世界的神秘面紗 在(zai)制(zhi)定(ding)了研究策略(lve)并(bing)進行了微(wei)(wei)生(sheng)物組分(fen)析后，面對(dui)結(jie)果(guo)數據是否仍是一(yi)頭霧水？α、β多樣(yang)性(xing)意味著什么(me)(me)？什么(me)(me)是關聯網絡？功能注釋的(de)奧秘何(he)在(zai)？以及binning分(fen)析又(you)是如何(he)助力(li)我(wo)們(men)探索的(de)？？接下(xia)來，我(wo)們(men)將逐一(yi)解(jie)開這些(xie)謎團，詳細(xi)闡述如何(he)解(jie)讀(du)微(wei)(wei)生(sheng)物組分(fen)析的(de)結(jie)果(guo)，幫助您深入理(li)解(jie)微(wei)(wei)生(sheng)物群落的(de)組成、結(jie)構(gou)和功能分(fen)析等。并(bing)通過知(zhi)識(shi)進階(jie)和拓展，讓您從小白進階(jie)到大牛！跟著小派(pai)繼續(xu)踏上這場充(chong)滿驚(jing)奇(qi)的(de)微(wei)(wei)生(sheng)物探索之旅吧！ 菌群多樣性組成譜 總體結果解讀 1、包含兩(liang)個視頻(pin)： ①基于(yu)QIME2平臺的全(quan)新分析(xi)流(liu)程及基因(yin)云分析(xi)平臺簡介(jie) 什么是(shi)QIME2及完整詳細多(duo)樣(yang)性(xing)報告解讀（基于云分析界面(mian)）。 ②從組成到(dao)功能：微(wei)生物組功能分析的意義和(he)方法 為什么要預測(ce)群(qun)落代謝功能；PICRUSt2功能預測(ce)簡(jian)介（改(gai)進、分(fen)析(xi)流程、不同功能預測(ce)的方法）。 //www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/2c3eb874e3af4a63bd5a966feb6f7691 2、一起來聊聊：QIIME2云(yun)分析的應用和拓展 QIIME2云(yun)(yun)分(fen)析(xi)(xi)簡(jian)介（流(liu)程(cheng)概述(shu)、基因云(yun)(yun)簡(jian)介）；重點分(fen)析(xi)(xi)內容(rong)剖(pou)析(xi)(xi)（基于PPT講解(jie)完整多樣性結果(guo)）；文獻(xian)分(fen)享；云(yun)(yun)分(fen)析(xi)(xi)實操(cao)（10分(fen)鐘快速(su)介紹所有內容(rong)） //www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/5852089e6b434dc99b217a8f62bf4da8 3、結題報告生成演示 //www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/single/4b559225f1144969b4d36083b60966e7 4、分組方案創建(jian) //www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/single/75221e51e0c6492a86450b2d68598391 分(fen)章結(jie)果解(jie)讀(du)（PPT+云分(fen)析實操） 6、微(wei)生物組(zu)云(yun)分(fen)析實操和數據挖掘1：序列處理(li)與物種(zhong)組(zu)成篇 //www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/single/6c9ddcaa7a5347b99aca50170518e421 7、微生物(wu)組云(yun)分析實操(cao)和(he)數據(ju)挖掘2：α、β多樣性分析 //www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/single/fb00c92c122d4ac886a5918c5ea13068 7.1、Alpha多樣性指數介紹 //www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/single/a00144f0cd1c47a7aef8e5602e498edb 7.2、稀(xi)疏曲線 //www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/single/bdcc9340b328465c8d2cf5e400768b58 8、微生物(wu)(wu)組云分析實操和數據挖掘3：物(wu)(wu)種差異與標志物(wu)(wu)種分析 //www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/single/7267a17164ff4df18a47a222ff7d5387 9、微生物組云分析(xi)實操和(he)數據挖掘5：關聯網絡分析(xi)與功能潛能預測(ce) //www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/890080927b664581b636bd76402e3fe2 進(jin)階(jie)1：關聯網絡云分(fen)析 網絡(luo)(luo)分析的種類和方法講解(jie)；網絡(luo)(luo)分析在微生物組中(zhong)的應用；基(ji)因云網絡(luo)(luo)分析實操；案例解(jie)讀 //www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/7cbcf27b5c6148a9b8bdc76baf3abda4 進(jin)階(jie)2：功能(neng)預測云(yun)分析 PICRUSt2分析(xi)和優勢(shi)；案例分享；云(yun)平臺演示(shi)；其(qi)他功(gong)能預測方法(fa)（Tax4Fun、Bagbase、FarProTax、FunGuild）；會后答疑 //www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/e1b25fe798a54cb79de7e40c11ba6bde 進階4：KEGG功能數據庫的使用 KEGG數據庫詳(xiang)細介紹；KEGG在微生物組中的(de)應(ying)用(yong)；KEGG數據庫實操 //www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/bbb5d6fd1b41424e9d5b3e242c50173a 宏基因組(zu)和(he)宏轉(zhuan)錄組(zu) 云平臺結果解讀 1、宏基(ji)因組和(he)宏轉錄組基(ji)礎分析講解1：數據處(chu)理分析 宏基因和宏轉(zhuan)錄介紹；分析流程；基于ppt介紹結(jie)果 //www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/2b2617b7bdf44ab298f8842ec7ac7079 2、宏基因(yin)組和(he)宏轉(zhuan)錄組功能分析(xi)講解(jie)2：功能水平(ping)分析(xi)介紹(shao) 差異(yi)分(fen)析與通路映射圖；富(fu)集(ji)分(fen)析；KEGG數據庫(ku)使用 //www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/b6dfe37d04fd44ceb9f08ba72356397e 3、宏基因組云平臺操作演示1：序(xu)列處理分析 宏基因組序列處理分析云(yun)平臺(tai)報告解讀(du) //www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/914fd6e0d28771ed80a06732b68f0102 4、宏基因組云平臺操作演示2：物種水(shui)平分析(xi) 派森諾物種(zhong)注釋的優(you)勢；宏基(ji)因(yin)組(zu)物種(zhong)水平(ping)分(fen)析云平(ping)臺報(bao)告解讀(du) //www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/3ce8f420d45271edb54c6733a78e0102 5、宏基因組云平臺操作演示(shi)3：功能水平分析 功能注釋的原理和優勢；14大(da)數據(ju)庫介紹；宏基因組物種水平分析云平臺(tai)報告(gao)解讀 //www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/22deaa10ea2971ed805c6732b68e0102 6、宏基因組云平臺(tai)操作演示4：數據集管理和物(wu)種功能對應分析 宏(hong)基因組數據集管理和物種功能對應分析云平(ping)臺報(bao)告(gao)解讀 //www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/ebed2760ea2971ed805c6732b68e0102 知識進(jin)階 8、基(ji)于reads的宏基(ji)因組(zu)，微生(sheng)物挖掘的新思路 基于reads的宏基因(yin)組(zu)原理介紹；宏基因(yin)組(zu)數據挖掘方法；案例分享 //www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/c0f6965a9fa471ee80590675b3ed0102 9、Binning分(fen)析(xi)講解 Binning原理(li)和應用；metaWRAP講解；報告解讀 //www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/a330417870da4050b3b658fb20052813 10、binning分(fen)析(xi)新流程，深入(ru)挖掘微生(sheng)物的潛能 宏基因組binning原理(li)和(he)升級(ji)介(jie)紹；各領域binning研(yan)究思路；binning案(an)例 //www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/90a3f5b3adc071eebfc34531859c0102 12、宏組學分析的應用和拓展 宏組學概況、分析流(liu)程介(jie)紹、分析內容介(jie)紹、案例(li)分享 //www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/7ee13c583eb141dfb386464e6956a94e 13、真(zhen)菌(jun)宏基因組(zu)，助力環境真(zhen)菌(jun)的(de)研究(jiu)（更多聚焦真(zhen)菌(jun)） 真菌(jun)宏基(ji)因(yin)組介紹；真菌(jun)宏基(ji)因(yin)組原(yuan)理和流(liu)程介紹；真菌(jun)宏基(ji)因(yin)組各類領域(yu)思(si)路；案例分享(xiang) //www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/50faa456adc171ee9c1e6732b78e0102
第四站(zhan) 繪圖教程-繪圖大師的魔法棒 在微(wei)生(sheng)物組學的(de)研究(jiu)中，數據(ju)可視化(hua)是不(bu)可或缺(que)的(de)一(yi)環。一(yi)個(ge)清晰、美觀(guan)的(de)數據(ju)圖(tu)表不(bu)僅(jin)能(neng)讓(rang)研究(jiu)結果躍然紙上，更(geng)能(neng)助力讀者輕松洞悉(xi)其深(shen)層含義，并贏得審(shen)稿人的(de)青睞。接下來，繼續(xu)我(wo)們(men)的(de)繪(hui)圖(tu)之旅，小派手把(ba)手教您如何運用派森諾云圖(tu)匯和代碼，將海(hai)量數據(ju)轉化(hua)為生(sheng)動(dong)圖(tu)片(pian)。讓(rang)我(wo)們(men)一(yi)起動(dong)手實踐，讓(rang)數據(ju)說(shuo)話！ （140+常見組學及科研圖(tu)片任您繪制(zhi)，注冊派森諾(nuo)基因(yin)云即可樂享(xiang)交互） 1、相關性分析 Spearman\pearson相關性；關聯網絡分(fen)析；RDA、CCA、VPA、PCoA-envfit //www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/single/9aa1e68286674fe583a935a80c50606a 2、微生(sheng)物組研究(jiu)中的云圖匯高頻應用 基(ji)因云(yun)(yun)介(jie)紹；云(yun)(yun)圖(tu)匯實操：差異檢驗箱(xiang)線(xian)圖(tu)、關(guan)聯(lian)熱(re)圖(tu)、RDA\CCA、韋(wei)恩圖(tu)、相關(guan)系數圖(tu)、PCo、關(guan)聯(lian)網絡 //www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/e75dcca543f74803a08713b4a309ad71 3、微生物(wu)組云圖(tu)匯高頻(pin)分析工具(ju)（最新） circos圖(tu)(tu)(tu)(tu)；差異檢(jian)驗(yan)箱(xiang)線圖(tu)(tu)(tu)(tu)；多功能差異檢(jian)驗(yan)圖(tu)(tu)(tu)(tu)；韋恩圖(tu)(tu)(tu)(tu)；upset圖(tu)(tu)(tu)(tu)；相關(guan)系數(shu)圖(tu)(tu)(tu)(tu)；RDA\CCA；關(guan)聯網絡；關(guan)聯熱圖(tu)(tu)(tu)(tu)；網絡熱圖(tu)(tu)(tu)(tu)（mantel test） //www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/535c35c0ea6271ed80446732b68f0102 4、微生物組R分析繪圖(tu)實戰 CCA；RDA；相關性熱圖講解和實操 //www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/daf5897c31db44f6908204a61b40d078
第五站
拓展延伸-探索微(wei)生物(wu)組(zu)的寶藏
在(zai)這一(yi)站，我們將踏上微生(sheng)物(wu)(wu)組(zu)(zu)學的(de)(de)深(shen)入(ru)探索之旅，帶您(nin)領略(lve)這一(yi)領域的(de)(de)廣(guang)闊天地和(he)(he)無限(xian)可(ke)能。小(xiao)派(pai)將介(jie)紹一(yi)些前(qian)沿的(de)(de)技(ji)術(shu)和(he)(he)工具，包括(kuo)常見數據庫介(jie)紹、孟(meng)德爾隨機化(hua)的(de)(de)應用(yong)、微生(sheng)物(wu)(wu)群落(luo)構(gou)建(jian)模型(xing)以及其他微生(sheng)物(wu)(wu)組(zu)(zu)測序技(ji)術(shu)等。這些技(ji)術(shu)和(he)(he)工具將幫(bang)助您(nin)更深(shen)入(ru)地理(li)解微生(sheng)物(wu)(wu)組(zu)(zu)學的(de)(de)奧(ao)秘，為您(nin)的(de)(de)研究提供新的(de)(de)思(si)路和(he)(he)方法(fa)。
1、MBPD數據庫：細菌病原微生物鑒定的新工具
病(bing)原微生物檢(jian)測方法概(gai)覽；MBPD數據(ju)庫(ku)(ku)簡介和其他數據(ju)庫(ku)(ku)比(bi)較；細(xi)菌(jun)病(bing)原數據(ju)庫(ku)(ku)應用案例
//www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/70c158b3941071ee856f6733a68f0102
Silva、Greengenes、UNITE、PR2、HOMD、Greengenes2、NCBI、GTDB
4、孟德爾(er)隨(sui)機化助力研究微生物與疾(ji)病的因果關系(xi)
孟德(de)爾隨機化原理和(he)(he)流程(cheng)和(he)(he)結果介(jie)紹(shao)；醫學(xue)微(wei)生物研究現狀；孟德(de)爾隨機化+微(wei)生物的案(an)例
//www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/30584a439fa571ee801f0764b3ec0102
6、微(wei)生物群落(luo)構建模型，環境微(wei)生物領域研究高分利器
環境微(wei)生物組研(yan)究介(jie)紹(shao)；微(wei)生物群落(luo)多樣(yang)性介(jie)紹(shao)；群落(luo)構建模型（NCM、βNTI、iCAMP、NST）解析多樣(yang)性機制介(jie)紹(shao)；研(yan)究案例
//www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/2301f4008e8171ee87880764a0ec0102
第(di)六站(zhan) 干貨滿滿-微生(sheng)物組學秘籍大放(fang)送(song) 經過一系列的探索(suo)和挑戰，我們終于抵達了終點站，想必您在前面(mian)的旅程中(zhong)已經積累了豐富的數據和精美的圖(tu)表。現在，是時候(hou)將這(zhe)些寶(bao)貴的成(cheng)果(guo)(guo)轉化為文(wen)字，給(gei)大家展示您的研究成(cheng)果(guo)(guo)了。沒有(you)思路？不知(zhi)道(dao)怎么應(ying)用數據？別擔心，小派最后為您準備了一系列實(shi)用的秘籍和技巧，助您在科研道(dao)路上更加從(cong)容自(zi)信(xin)。 1、微生物組學術(shu)論文撰寫方(fang)法與經典案例(li)解讀 論(lun)文該怎么寫；微(wei)生物組(zu)論(lun)文撰寫思(si)路(lu)；微(wei)生物組(zu)常用(yong)圖(tu)表解(jie)讀(du)；案例(li)分享 //www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/e08b38f4b5a271eebfa74531948c0102
3、微生物組測序數據上傳NCBI實操(cao)
//www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/single/3944facef821476c97230f5e73cd3367
在(zai)(zai)微(wei)生物(wu)(wu)組學(xue)的(de)奇幻之旅(lv)中(zhong)，從第(di)一(yi)站的(de)思路(lu)大(da)派送，到第(di)六站的(de)秘籍(ji)全攻略，每(mei)(mei)一(yi)步都凝聚(ju)著我們(men)(men)對微(wei)生物(wu)(wu)組學(xue)奧秘的(de)無限好(hao)奇與不(bu)懈追求。感(gan)謝每(mei)(mei)一(yi)位(wei)與我們(men)(men)一(yi)起(qi)踏上(shang)這段旅(lv)程(cheng)的(de)伙伴，希(xi)望這些干貨滿(man)滿(man)的(de)教(jiao)程(cheng)和(he)秘籍(ji)助您在(zai)(zai)微(wei)生物(wu)(wu)組學(xue)的(de)世界里游刃有余。讓我們(men)(men)繼續前行，在(zai)(zai)微(wei)生物(wu)(wu)組學(xue)的(de)廣(guang)闊天(tian)地中(zhong)探索更多(duo)的(de)未知(zhi)，創(chuang)造更多(duo)的(de)可能(neng)。探索之旅(lv)，永遠在(zai)(zai)路(lu)上(shang)！
