2024-11-18
隨著生(sheng)命科(ke)學(xue)(xue)研究的(de)(de)深(shen)入(ru),宏(hong)(hong)(hong)蛋(dan)白(bai)(bai)組(zu)學(xue)(xue)正成為(wei)揭示微(wei)生(sheng)物(wu)(wu)(wu)群(qun)落在環境(jing)(jing)、健康和(he)生(sheng)態系統中作用的(de)(de)關鍵工具(ju)。相比(bi)傳統的(de)(de)蛋(dan)白(bai)(bai)組(zu)學(xue)(xue)分析,宏(hong)(hong)(hong)蛋(dan)白(bai)(bai)組(zu)學(xue)(xue)能夠更(geng)全面地捕捉環境(jing)(jing)樣本中多種(zhong)微(wei)生(sheng)物(wu)(wu)(wu)的(de)(de)蛋(dan)白(bai)(bai)質表達和(he)功(gong)能活動(dong),為(wei)理解群(qun)落內部復(fu)雜的(de)(de)代(dai)謝網(wang)絡、生(sheng)態功(gong)能以及微(wei)生(sheng)物(wu)(wu)(wu)間(jian)相互作用提(ti)供(gong)了獨(du)特視角,可(ke)作為(wei)宏(hong)(hong)(hong)基因組(zu)研究很(hen)好的(de)(de)補充,甚(shen)至有(you)著宏(hong)(hong)(hong)基因無(wu)法替代(dai)的(de)(de)優勢。宏(hong)(hong)(hong)蛋(dan)白(bai)(bai)組(zu)研究在環境(jing)(jing)治理、農(nong)業生(sheng)產、以及人(ren)類健康等(deng)領域都(dou)具(ju)有(you)廣闊(kuo)前景,例(li)如幫(bang)助分析環境(jing)(jing)污染的(de)(de)微(wei)生(sheng)物(wu)(wu)(wu)修(xiu)復(fu)潛(qian)力(li)、探索腸道菌(jun)群(qun)對健康的(de)(de)影響、或揭示農(nong)田(tian)微(wei)生(sheng)物(wu)(wu)(wu)的(de)(de)共生(sheng)機制。
前不久,我(wo)們跟大家隆重(zhong)介紹了(le)派(pai)森諾(nuo)常規蛋(dan)白組(zu)分(fen)析的(de)重(zhong)磅(bang)升(sheng)(sheng)(sheng)級(重(zhong)磅(bang)升(sheng)(sheng)(sheng)級!Astral蛋(dan)白組(zu)學(xue)(xue)分(fen)析內(nei)容革命性升(sheng)(sheng)(sheng)級大揭秘!點擊查看(kan)),在(zai)該基礎上(shang),我(wo)們又對宏蛋(dan)白組(zu)學(xue)(xue)分(fen)析內(nei)容做了(le)全面優化,升(sheng)(sheng)(sheng)級后的(de)流(liu)程更(geng)能適應不同分(fen)析需(xu)求的(de)復(fu)雜(za)性,提升(sheng)(sheng)(sheng)了(le)分(fen)析的(de)靈敏度和(he)準確性,并在(zai)報告(gao)內(nei)容上(shang)進行了(le)更(geng)具可讀(du)性和(he)生物(wu)學(xue)(xue)意義(yi)的(de)增強。通過這些改(gai)進,我(wo)們希望為(wei)研究者提供(gong)更(geng)加豐富的(de)宏蛋(dan)白組(zu)數據洞察,助(zhu)力在(zai)前沿領域探(tan)索未知,推(tui)動(dong)相關應用研究邁向更(geng)高水平。下面我(wo)們一(yi)起看(kan)看(kan)我(wo)們全新的(de)宏蛋(dan)白質(zhi)組(zu)學(xue)(xue)分(fen)析內(nei)容吧!
一、全面且豐富的分(fen)析(xi)內容
全新的宏蛋白組學分析內容包含五大分析模塊、四十二(er)項分析內容(rong)。除了常規 的質控分析、差異蛋白及功能分析,本次升級的重點是物(wu)種和微生物(wu)功能相關的分(fen)析(xi)內(nei)容(rong),從(cong)蛋白的(de)維度解析微(wei)生物的(de)多樣(yang)性和功(gong)能。
二、豐富的物種注釋及菌群分析
新的(de)宏蛋白(bai)組(zu)分析報告繼承了(le)(le)前面(mian)常規(gui)蛋白(bai)組(zu)升級(ji)的(de)內容,不僅框架更加合理(li),可(ke)讀性(xing)、便捷性(xing)等(deng)(deng)各(ge)方面(mian)都(dou)有(you)了(le)(le)提升,與常規(gui)蛋白(bai)組(zu)的(de)不同(tong)之處,就是微生物(wu)物(wu)種(zhong)注(zhu)釋分析的(de)升級(ji),我們采用了(le)(le)全新的(de)物(wu)種(zhong)注(zhu)釋算法,使得基于宏蛋白(bai)的(de)物(wu)種(zhong)注(zhu)釋更加的(de)科(ke)學、準確,同(tong)時(shi)增加了(le)(le)很多優美的(de)圖(tu)片展(zhan)示,包括物(wu)種(zhong)組(zu)成柱形圖(tu)、和弦圖(tu)、熱(re)圖(tu)、群落KRONA分析等(deng)(deng)多種(zhong)形式。
物種組成分析(xi)
物種(zhong)多樣性及差異分析
三(san)、物種-功能分析
宏(hong)蛋白組(zu)的(de)(de)(de)功能分(fen)(fen)析(xi)不(bu)僅(jin)涵(han)蓋了(le)常規的(de)(de)(de)GO、KEGG和(he)結構域(yu)注釋,還特別新增(zeng)了(le)與微(wei)生(sheng)物密切(qie)相(xiang)關的(de)(de)(de)功能分(fen)(fen)析(xi)模塊(kuai),例如抗生(sheng)素抗性(xing)基(ji)因(yin)分(fen)(fen)析(xi)(CARD)、糖基(ji)水解(jie)酶分(fen)(fen)析(xi)(CAZy)以及毒力因(yin)子分(fen)(fen)析(xi)(VFD)等。這些(xie)新增(zeng)分(fen)(fen)析(xi)內容顯著拓展了(le)宏(hong)蛋白組(zu)研究視角(jiao),為深入探索微(wei)生(sheng)物群落的(de)(de)(de)抗性(xing)機制、代謝潛能和(he)毒力特征提供了(le)更全面的(de)(de)(de)數據支(zhi)持。
物種-功能相關(guan)分析(xi)
本次(ci)升級同時也(ye)增加了一(yi)些(xie)新(xin)的(de)圖形(xing)和(he)展現(xian)形(xing)式,基(ji)于微生物不同分(fen)類水平、不同功能注釋模(mo)塊等,提供了更加多樣化的(de)分(fen)析(xi)內(nei)容。
其他分析(xi)內(nei)容(rong)及圖形展示
派(pai)森諾質(zhi)譜平臺自(zi)創立以來始終(zhong)秉(bing)持(chi)創新(xin)驅動的(de)(de)理(li)念,不斷(duan)探索并優(you)化(hua)蛋白質(zhi)組學和(he)代謝(xie)組學產(chan)品的(de)(de)服務內容和(he)質(zhi)量。憑(ping)借不斷(duan)提升(sheng)的(de)(de)服務標準,派(pai)森諾致力于為廣大科研(yan)工作(zuo)(zuo)者提供精準、高效的(de)(de)支持(chi),加(jia)速科研(yan)發現(xian)的(de)(de)步伐,助力生命科學的(de)(de)前沿探索。更(geng)多的(de)(de)優(you)化(hua)升(sheng)級(ji)將不斷(duan)推出,期待您的(de)(de)合作(zuo)(zuo)!