2024-11-23
在差(cha)異(yi)表達(da)分(fen)析(xi)領域，靜(jing)態(tai)火(huo)山(shan)(shan)圖(tu)(tu)(tu)、交互式火(huo)山(shan)(shan)圖(tu)(tu)(tu)、多組間比(bi)較的(de)火(huo)山(shan)(shan)圖(tu)(tu)(tu)以及差(cha)異(yi)表達(da)分(fen)析(xi)圖(tu)(tu)(tu)表扮演著(zhu)不(bu)可或缺的(de)角色，極大地(di)促進了(le)數據(ju)分(fen)析(xi)過程的(de)簡化(hua)與(yu)直觀(guan)化(hua)。它們不(bu)僅讓繁瑣的(de)數據(ju)分(fen)析(xi)過程變得便捷(jie)易操作，還(huan)顯著(zhu)增強(qiang)了(le)研究(jiu)人員捕(bu)捉關鍵(jian)信息和準(zhun)確解讀(du)數據(ju)的(de)能力。接下來(lai)，讓我們一起看(kan)看(kan)，如何通過精(jing)細的(de)分(fen)析(xi)參(can)數及豐富的(de)調整(zheng)圖(tu)(tu)(tu)表，來(lai)創建既符合科學標準(zhun)又美(mei)觀(guan)大方(fang)的(de)專(zhuan)業級圖(tu)(tu)(tu)表，以達(da)到甚至超(chao)越(yue)頂級期刊(kan)發表文章的(de)質量水(shui)平(ping)吧~（夸下海口）
一、靜(jing)態火山(shan)圖
靜(jing)態火山圖，用于展示一(yi)個比較組的基(ji)因差異表(biao)達數據，以不(bu)同的顏色來(lai)區(qu)分上調、下調、非顯著(zhu)差異表(biao)達的基(ji)因，還支持在圖表(biao)中(zhong)標記特定基(ji)因名稱。
二、交互火山圖
交(jiao)互(hu)火山圖與(yu)靜態火山圖相比較，在數據(ju)處理上更為(wei)迅(xun)速，圖表交(jiao)互(hu)實(shi)時響應，極大程度地縮(suo)短了繪圖響應時間(jian)。
三、多組差異火山圖
多組差異火(huo)山圖(tu)是一種用于同時展(zhan)示多個比(bi)較(jiao)組之間基因表(biao)達差異數據的(de)火(huo)山圖(tu)。每(mei)種顏色的(de)色塊(kuai)分布(bu)表(biao)示不同的(de)比(bi)較(jiao)組，每(mei)個比(bi)較(jiao)組的(de)上調、下調基因分別位于色塊(kuai)的(de)上下方。
標記基因
我們也(ye)可(ke)以在多組差異火(huo)山圖中標記特定的基(ji)因(yin)，還可(ke)以對(dui)標簽進行拖拽，以便清(qing)晰明了地讀(du)取(qu)感興趣的基(ji)因(yin)的表(biao)達(da)數(shu)據。
四(si)、差(cha)異表達分析
該工具(ju)對差異表達(da)分析結果中顯著差異基因(yin)集進(jin)行了統計，并對不同比(bi)較組之間(jian)的(de)差異基因(yin)做柱(zhu)狀圖(tu)，統計出每個比(bi)較組的(de)上調差異基因(yin)和下(xia)調差異基因(yin)數量。
我(wo)們(men)(men)在繪圖(tu)(tu)的時候需(xu)要準備的數(shu)(shu)據文(wen)件(jian)(jian)有(you)三種，分(fen)別是(shi)數(shu)(shu)據文(wen)件(jian)(jian)、分(fen)組文(wen)件(jian)(jian)、比較組文(wen)件(jian)(jian)。在提交繪圖(tu)(tu)時候我(wo)們(men)(men)可以根據繪圖(tu)(tu)需(xu)求，選擇不(bu)同(tong)的分(fen)析方(fang)法、差異倍數(shu)(shu)、顯著性檢驗(yan)、顯著性水平。在繪圖(tu)(tu)中(zhong)，如果(guo)遇到(dao)參數(shu)(shu)拿(na)捏不(bu)準的時候，可以隨時借助(zhu)我(wo)們(men)(men)PAI繪圖(tu)(tu)小助(zhu)手進行了解(jie)哦，如下圖(tu)(tu)所示：
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