2025-01-20
熱(re)圖(tu)，作為一種強大的(de)數(shu)據可視(shi)化(hua)手段，以獨特(te)的(de)色(se)彩(cai)矩陣形式(shi)呈現數(shu)據。通過(guo)顏色(se)的(de)深淺變(bian)化(hua)，能(neng)直(zhi)觀反映數(shu)據的(de)大小、趨(qu)勢或(huo)差異。在生物(wu)學(xue)領域，可用(yong)于展(zhan)示基因(yin)表達(da)量的(de)變(bian)化(hua)。科(ke)研人員能(neng)夠快速定位(wei)在不同樣本中，哪(na)些基因(yin)的(de)表達(da)水平顯著(zhu)升高或(huo)降低(di)，從而篩選出可能(neng)與特(te)定生物(wu)過(guo)程相關的(de)關鍵基因(yin)。派森諾基因(yin)云(yun)今(jin)天將與大家(jia)分享兩款(kuan)經典可視(shi)化(hua)工(gong)具(ju)(ju)——分別是熱(re)圖(tu)和交(jiao)互熱(re)圖(tu)。兩款(kuan)熱(re)圖(tu)工(gong)具(ju)(ju)都能(neng)輕松(song)應對不同場景，一起來看(kan)看(kan)吧(ba)~
一、熱圖
熱圖可通過著色的(de)(de)單元格(ge)，展(zhan)示(shi)各基因的(de)(de)表(biao)達量(liang)高低。
1.1 數據文件
第一列對應的是基(ji)因名(ming)稱，其他列對應的是基(ji)因在(zai)樣品中的表達量值。
1.2 參數設置
熱(re)圖提供3種標(biao)準(zhun)化(hua)的模式，分(fen)別(bie)是row（行標(biao)準(zhun)化(hua)）、column（列標(biao)準(zhun)化(hua)）、none（不標(biao)準(zhun)化(hua)）。
同樣也提供(gong)了4種聚(ju)類方(fang)式分別是row（行(xing)聚(ju)類）、column（列聚(ju)類）、both（行(xing)列聚(ju)類）、none（不聚(ju)類）。具(ju)體選擇哪種聚(ju)類方(fang)式，根據(ju)分析(xi)要(yao)求而定。
二、交互熱圖
上(shang)面提到(dao)的(de)熱圖(tu)圖(tu)表(biao)，調(diao)整參數(shu)豐富，但并不支(zhi)持(chi)調(diao)整后(hou)繪圖(tu)結果實時(shi)變換，您需(xu)要(yao)等待更新繪圖(tu)再查看(kan)結果。為此(ci)，我們潛心研發出了交互熱圖(tu)，實現參數(shu)調(diao)整實時(shi)生效，并且在(zai)熱圖(tu)的(de)基(ji)礎上(shang)增加了其他(ta)的(de)圖(tu)表(biao)功能。
2.1 數(shu)據文(wen)件
交(jiao)(jiao)互熱(re)圖和熱(re)圖數據文(wen)件(jian)一致，但(dan)還需(xu)要一份分(fen)(fen)組文(wen)件(jian)，因(yin)此(ci)交(jiao)(jiao)互熱(re)圖能夠支持分(fen)(fen)組數據的(de)展示(shi)。分(fen)(fen)組文(wen)件(jian)中(zhong)第(di)一列為樣品名稱(cheng)，第(di)二列為樣品所對應的(de)分(fen)(fen)組名稱(cheng)。
2.2 圖(tu)表(biao)調整
基因名稱顯示
可根據需要(yao)來選(xuan)擇顯示和(he)隱藏(zang)基(ji)因(yin) / 樣(yang)品名稱，當數據量大時，可以(yi)避(bi)免圖表(biao)(biao)名稱堆疊過于雜(za)亂，輕松查看(kan)特定(ding)基(ji)因(yin) / 樣(yang)品的表(biao)(biao)達情況(kuang)。
圖表寬高調整
我們(men)可以根據需要(yao)，橫向(xiang)或者豎向(xiang)伸縮單元(yuan)格(ge)，進而合(he)理的調整圖表的寬度和高度。
單元格(ge)樣(yang)式
我們提供4種(zhong)單元格樣式：正方(fang)形(xing)、顏色、橢圓、數(shu)字，為圖(tu)表展示(shi)增加多(duo)樣性，更好地滿足(zu)數(shu)據(ju)可(ke)視化需求。
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