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6款組合類圖表,在基因云就能輕松得到!

2025-01-23

這(zhe)次(ci)給大家(jia)(jia)分享一下(xia),6款來自基(ji)(ji)因云組(zu)合類型的圖(tu)表(biao),它(ta)們融合了(le)多種基(ji)(ji)礎圖(tu)表(biao),相較于單一圖(tu)表(biao),組(zu)合圖(tu)表(biao)以更(geng)豐富(fu)的信息(xi)展(zhan)現(xian)與更(geng)強視(shi)覺沖擊力(li)。大家(jia)(jia)不(bu)要錯(cuo)過這(zhe)個(ge)組(zu)合圖(tu)表(biao)哦,趕緊來試一試。在繪(hui)圖(tu)過程中,如果遇到任(ren)何(he)關于繪(hui)圖(tu)參數(shu)含義,或是遇到其(qi)他繪(hui)圖(tu)難題,不(bu)妨借(jie)助我們的PAI繪(hui)圖(tu)助手,更(geng)快的幫您解決(jue)問題。

一、網絡熱(re)圖

由熱圖和網絡圖組成,熱(re)圖展示組學內的相關性,而網絡圖則展示組學(xue)間的關(guan)聯性(xing)。網絡熱圖(tu)樣式(shi)新穎,應用廣泛,常(chang)用于展示微(wei)生物豐度與環境因(yin)子(zi)之間的關(guan)聯關(guan)系(xi)。

添加(jia)node節點:默認(ren)一(yi)個節點(dian),需要展示(shi)多個關聯(lian)節點(dian)與(yu)環境因(yin)子(zi)關聯(lian)關系時,可通過" + "新增節點(dian)。通過這種方式,我們(men)可以更加(jia)詳(xiang)細地(di)展示(shi)復雜的網絡關系,并(bing)更好地(di)理解不同節點(dian)與(yu)環境因(yin)子(zi)之間(jian)的交互和影響(xiang)。

二(er)、交(jiao)互(hu)熱圖柱(zhu)狀圖

通過熱(re)圖(tu)柱(zhu)狀圖組(zu)合(he)的(de)形式展示(shi)數據特征,從而更加地直觀反映(ying)樣(yang)品 / 組(zu)內(nei)或組(zu)間(jian)的(de)差(cha)異。

(1)熱(re)圖:用于展(zhan)示物種在(zai)樣品(pin)中的豐度值、基因在(zai)樣品(pin)中的表達量等數據,

(2)柱狀圖:用于展示物種對于分(fen)類器(qi)模型的(de)重要(yao)性打分(fen)值(zhi)、基因表達(da)差異(yi)倍數等。

根(gen)據我們的(de)繪圖(tu)結(jie)果(guo),我們可(ke)以(yi)適當地調整圖(tu)表的(de)寬度和高度。這(zhe)樣的(de)操(cao)作可(ke)以(yi)使圖(tu)表展示更加(jia)舒適、美(mei)觀,并且更易于查看數據。

三(san)、環形分組柱狀(zhuang)圖

通過柱(zhu)狀(zhuang)圖環形圖結合,我們可以清晰(xi)地展示不同(tong)組之間數(shu)據的(de)分(fen)布特征,環形色塊(kuai)表示對(dui)應(ying)的(de)分(fen)組,而環形內部的(de)柱形,對(dui)應(ying)每個(ge)樣品(pin)或類(lei)別的(de)數(shu)值。

我們可以分別(bie)調整環形圖內外(wai)半徑的大小,以擴(kuo)大圖表(biao)的展示(shi)范圍,讓數據(ju)更清晰地呈現。

四(si)、組合(he)密度圖(tu)

它是(shi)將多個數據(ju)的(de)分(fen)布(bu)情況疊加在一(yi)起展示,形成一(yi)個綜合類型(xing)的(de)圖表,方便(bian)快速了解(jie)數據(ju)的(de)分(fen)布(bu)特征。

組合密度圖提供五(wu)種圖表樣式:分別是核密(mi)(mi)度(du)圖(tu)、散點密(mi)(mi)度(du)圖(tu)、直(zhi)方密(mi)(mi)度(du)圖(tu)、六邊(bian)形(xing)密(mi)(mi)度(du)圖(tu)、回歸密(mi)(mi)度(du)圖(tu)。

組(zu)合密度圖(tu)調(diao)整項多樣(yang)且靈活,通(tong)過調(diao)整圖(tu)形(xing)的高度、主圖(tu)和(he)邊(bian)圖(tu)的設置等,設計出符合自己需求的個性(xing)化(hua)圖(tu)表(biao)。

五、聚類(lei)條(tiao)形圖

條形圖(tu)與聚(ju)類樹圖(tu)相結(jie)合,通(tong)過聚(ju)類的方式將基因表達數據按(an)照相似性進(jin)行分組。

聚類樹(shu):展示樣品間的相似度(du),樣品(pin)間(jian)的分支長(chang)度越短,表示兩樣品(pin)越相似。

條形圖:展示排名topN的(de)元(yuan)素在各(ge)樣品(pin)中的豐度(du)情況,元素對應矩形越長,表示在樣品(pin)中豐度(du)越高。

距離算法:jaccard 或 bray_curtis。

聚類(lei)方式(shi):目前提供8種,ward.D,ward.D2,single,complete,average,mcquitty,median,centroid 。

六、交互云(yun)雨圖(tu)

云雨圖(tu)主要(yao)由(you)核密度(du)曲線(xian)圖(tu)、箱線(xian)圖(tu)和散點圖(tu)三部分組成,通過圖(tu)表組合的(de)呈(cheng)現(xian)方式,能夠(gou)更(geng)加全(quan)面地展示數據的(de)分布趨勢和關系。

(1)核密度曲線圖(云朵):展示數據(ju)的趨(qu)勢和(he)變化情況(kuang);

(2)箱(xiang)線(xian)圖(盒子):展示數據的分布情(qing)況(kuang);

(3)散點圖(雨點):展示數(shu)據(ju)點之間的關系和(he)分(fen)布情況。

交互云雨圖有3種圖表類型可供切換,分別是:云(yun)(yun)雨(yu)箱線圖(tu)、云(yun)(yun)箱線圖(tu)、和(he)云(yun)(yun)雨(yu)圖(tu)。

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