2025-02-12
表觀遺傳調控是生命科學研究的核心領域之一，它通過DNA甲基化、RNA修飾、染色質開放性和蛋白-DNA互作等機制，在不(bu)改變DNA序(xu)列的前提下調(diao)控基(ji)因(yin)表達(da)。隨著高(gao)通(tong)量(liang)測序技術的發展，表(biao)(biao)觀調控(kong)(kong)(kong)研究(jiu)已進(jin)入精(jing)準化時代。今(jin)天小編將為您(nin)介紹派森諾六(liu)大核心表(biao)(biao)觀調控(kong)(kong)(kong)測序產品(pin)（圖 1），助您(nin)解鎖基因(yin)表(biao)(biao)達的神秘調控(kong)(kong)(kong)網絡。
圖(tu) 1 派森諾表觀調控產(chan)品
1. WGBS（全基(ji)因組甲基(ji)化(hua)測序）
英文全(quan)稱：Whole Genome Bisulfite Sequencing
測序(xu)內容(rong)：全基因(yin)組范圍內單堿基分(fen)辨率的DNA甲基化(hua)水平檢測（5mC）。
測(ce)序原理：利用(yong)重亞(ya)硫酸鹽處(chu)理DNA，將未甲(jia)基(ji)(ji)化的胞嘧啶（C）轉化為尿(niao)嘧啶（U），而(er)甲(jia)基(ji)(ji)化C保持不變。通(tong)過高(gao)通(tong)量測序(xu)比對，精準定位甲(jia)基(ji)(ji)化位點(dian)。
技術流程：
1、DNA提取與(yu)重亞硫(liu)酸(suan)鹽轉化
2、全基因組文庫構建
3、高通量測序（PE150）
4、生物信息學分(fen)析（甲(jia)基化水平計算、差(cha)異區域篩選）
2. MeRIP-seq（甲基化RNA免疫(yi)共沉淀(dian)測序）
英文全(quan)稱(cheng)：Methylated RNA Immunoprecipitation Sequencing
測序內容(rong)：全轉錄組水平的RNA甲(jia)基化（m6A）修飾位點鑒定。
測序原理：通過特異性抗體富集甲基(ji)化修飾的RNA片(pian)段，結合測序分析(xi)修飾位(wei)點(dian)分布。
技術流程：
1、RNA片(pian)段化與抗m6A抗體孵育
2、免疫沉淀富集(ji)甲基化RNA
3、建庫測序與修(xiu)飾峰識(shi)別
4、功能(neng)注釋（motif分析、基因關聯）
3. ChIP-seq（染色質免疫共沉淀測(ce)序(xu)）
英文全稱(cheng)：Chromatin Immunoprecipitation Sequencing
測序內容：特定蛋(dan)白（如組蛋(dan)白修飾、轉錄因(yin)子）在基因(yin)組上(shang)的結合位點。
測序原理(li)：通過抗體捕(bu)獲與DNA結(jie)合的靶蛋白復合物，釋放并測序結(jie)合區域的DNA。
技術流程：
1、甲醛交聯固定蛋白-DNA復(fu)合物
2、染色質(zhi)剪切與(yu)抗體免疫沉(chen)淀
3、DNA純化與文庫構(gou)建
4、測序及peak calling分析
4. CUT&Tag（靶向切(qie)割與標(biao)簽化測序）
英文全稱：Cleavage Under Targets and Tagmentation
測序內容：高效檢測染色(se)質結合(he)蛋白或組(zu)蛋白修飾(shi)的精確位點。
測序原理：在細胞(bao)內直(zhi)接完(wan)成抗體識別靶蛋白、Tn5轉座酶靶向切割并插入測序接頭，大幅提高信噪比。
技術(shu)流(liu)程：
1、細(xi)胞透(tou)化與靶標抗(kang)體孵育(yu)
2、Protein A-Tn5轉座酶(mei)復合物結(jie)合
3、靶向染色質(zhi)切割與標簽插入(ru)
4、片段釋放、PCR擴增與測(ce)序
優(you)勢：分(fen)辨率高、樣本量少（低至(zhi)5000個細(xi)胞）、背景(jing)噪音低。
5. RIP-seq（RNA結合蛋白免(mian)疫沉淀測序(xu)）
英文(wen)全稱：RNA Immunoprecipitation Sequencing
測序內容(rong)：鑒定與特定RNA結(jie)合蛋白（RBP）相互作用的(de)RNA分子。
測序原理：利用抗體富集RBP-RNA復合物，解析RNA結(jie)合圖(tu)譜(pu)。
技術流(liu)程：
1、細胞(bao)裂解(jie)與RBP-RNA復合物提(ti)取
2、抗體免疫沉淀靶蛋白及結合RNA
3、RNA純(chun)化與文庫構(gou)建
4、測序與結合靶點分析
6. ATAC-seq（染色(se)質可及性測(ce)序）
英文(wen)全稱：Assay for Transposase-Accessible Chromatin using Sequencing
測序內容：全基因組染色質開放(fang)區(qu)域(yu)（調控(kong)元件如啟動子、增強子）。
測序原(yuan)理(li)：利(li)用Tn5轉座(zuo)酶優先切割開放染(ran)色質區(qu)域(yu)并插(cha)入(ru)測(ce)序接(jie)頭。
技術流程：
1、細胞核提取與Tn5轉座酶處理
2、文庫擴增與測序
3、開放區域peak分析
4、轉錄因子結合motif預測(ce)
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高分(fen)辨率(lv)數據：單堿基精度（WGBS）至單細胞水(shui)平（ATAC-seq）。
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