2025-04-08
引 言(yan)
在生命科(ke)學(xue)的(de)浩(hao)瀚宇宙(zhou)中, 單細胞(bao)轉(zhuan)錄組學(xue)為揭示(shi)細胞(bao)異(yi)質性、發育過程及疾(ji)病機制提供了前所未有的(de)視角。然(ran)而,單細胞(bao)數據(ju)的(de)復雜性和分析(xi)難度給研究(jiu)者(zhe)們帶來(lai)了巨大的(de)挑戰。
基于此,派森諾生物重磅推出的單細胞(bao)轉錄組云平臺與各位科(ke)研工(gong)作者正(zheng)式(shi)見面!該平臺極大(da)簡(jian)化了單(dan)細胞數(shu)據分(fen)析流(liu)程(cheng),即使零編程(cheng)經驗的研究人員也能輕松完成單(dan)細胞數(shu)據分(fen)析。
單(dan)細(xi)胞(bao)云平臺亮點展示
01、結構(gou)布局清(qing)晰,做有靈性的云(yun)平臺
派森諾單細胞云平臺采用模塊化設計理念,將單細胞數據分析流程整合為數(shu)據質控過(guo)濾、分析內容選(xuan)擇、結果展示(shi)三(san)大(da)模塊。該架構(gou)深度(du)契合廣大(da)科研工作者們單細(xi)胞數(shu)據分析思路,顯著(zhu)提升單細(xi)胞數(shu)據分析的效率。
頁面設計(ji)
① 數(shu)(shu)據過濾(lv)(lv)質(zhi)控(kong):用(yong)于(yu)數(shu)(shu)據過濾(lv)(lv)、注(zhu)釋(shi)細胞(bao)集選擇等(deng);
② 分(fen)(fen)析(xi)(xi)(xi)內(nei)容選擇:用于制定(ding)分(fen)(fen)析(xi)(xi)(xi)內(nei)容。分(fen)(fen)析(xi)(xi)(xi)內(nei)容包(bao)括基因(yin)(yin)集(ji)打分(fen)(fen)、差(cha)異(yi)基因(yin)(yin)富集(ji)分(fen)(fen)析(xi)(xi)(xi)、細(xi)胞(bao)通訊、擬時(shi)序(xu)分(fen)(fen)析(xi)(xi)(xi)、基因(yin)(yin)可視化(hua)等單(dan)細(xi)胞(bao)常用分(fen)(fen)析(xi)(xi)(xi);
③ 結果展示(shi):選擇(ze)好分(fen)(fen)析(xi)內容后,在此(ci)查(cha)看(kan)分(fen)(fen)析(xi)結果。
02、分析內容多元化,直擊科研痛點(dian)
①功(gong)能齊(qi)全,分析內容(rong)豐富
云平臺全面覆蓋單細胞高分文章中核心分析模塊,包括數(shu)據(ju)質(zhi)控過(guo)濾、細(xi)(xi)胞聚(ju)類分(fen)群、細(xi)(xi)胞類型注釋、細(xi)(xi)胞亞群再細(xi)(xi)分(fen)、基(ji)(ji)因(yin)集打分(fen)、差異(yi)基(ji)(ji)因(yin)富(fu)集分(fen)析、細(xi)(xi)胞通訊、擬時序(xu)分(fen)析、基(ji)(ji)因(yin)可視化等內容。所有分析(xi)模塊均經過嚴格的(de)算法(fa)優化,支持多(duo)維度參數配置,既滿足標(biao)準化分析(xi)需求(qiu),又可(ke)靈活適配個性化研究場景(jing),為科研人員提供從原(yuan)始數據到可(ke)視(shi)化結果的(de)一站式解決方案。
②交互式細胞集(ji)選擇
派森諾(nuo)單細胞(bao)(bao)(bao)云平(ping)臺為用戶(hu)提供了交互(hu)式細胞(bao)(bao)(bao)篩選功能(neng),用戶(hu)可(ke)(ke)通過(guo)可(ke)(ke)視化界面手動圈選目(mu)標細胞(bao)(bao)(bao)群,點擊(ji)數據(ju)過(guo)濾,即(ji)可(ke)(ke)實現對(dui)特定細胞(bao)(bao)(bao)亞(ya)群的(de)精準(zhun)分離,從而靈活地(di)為后續(xu)分析提供準(zhun)確的(de)目(mu)標細胞(bao)(bao)(bao)數據(ju)。
③擬時序分(fen)析創新(xin)與完善
擬(ni)時(shi)序分(fen)(fen)析(xi)(xi)已經(jing)成為單(dan)細胞(bao)數據分(fen)(fen)析(xi)(xi)中最受(shou)歡迎的分(fen)(fen)析(xi)(xi)之(zhi)一,本次派(pai)森諾單(dan)細胞(bao)云(yun)平臺進(jin)一步對擬(ni)時(shi)序分(fen)(fen)析(xi)(xi)進(jin)行了創(chuang)新與完善 :
創新:傳統擬時序分析中,起始細胞類型需通過二次分析確定,而派森諾單細胞云平臺突破性實現了自定義起始細胞類型的功能,可直接人為錨定目標細胞亞群進行軌跡推演,有效減少了重復分析步驟,顯著提升了時序分析效率。 只需在分析模塊勾選 手動選擇根節點 ,即可指定某一細胞類型為(wei)擬(ni)時序(xu)起點。
完善:在(zai)擬時序分析(xi)(xi)中(zhong),beam分析(xi)(xi)在(zai)挖(wa)掘不同(tong)分支(zhi)關鍵基因(yin)時極為重要(yao),本次單(dan)細胞(bao)云平臺新增了這(zhe)一功能,顯(xian)著增強了軌(gui)跡分析(xi)(xi)的深度(du)(du)和廣度(du)(du)。
(圖中橫坐標為(wei)擬時(shi)間的點,從中間往兩(liang)邊讀為(wei)兩(liang)條發育分(fen)支的擬時(shi)間順(shun)序;縱坐標為(wei)基因(yin)(yin),根據基因(yin)(yin)在(zai)不同分(fen)支上的表(biao)(biao)達(da)趨勢(shi),將基因(yin)(yin)分(fen)為(wei)不同模式。基因(yin)(yin)顏色的變化,代表(biao)(biao)基因(yin)(yin)表(biao)(biao)達(da)由低到高(gao)。)
03、文章級精美圖片(pian)原圖直(zhi)出(chu)
“一魚多吃”,富集(ji)分析4種展示形(xing)式、基因可視化5種展示形(xing)式
派森諾(nuo)單細胞云(yun)平臺(tai)給用(yong)戶(hu)提供多種精美結果圖片的同(tong)時,兼顧(gu)高效交互(hu)響(xiang)應,全面支持用(yong)戶(hu)的高分期刊發表需求。
富(fu)集分析(xi)圖片(pian)展示:
基因可視化(hua)圖片展示:
其余精美圖片展示:
04、獨有細(xi)胞注釋數據庫
派(pai)森諾獨有的(de)注(zhu)釋團隊,基(ji)于各大(da)已發表文獻、數(shu)據(ju)庫及豐富的(de)項目經驗(yan),自建細胞自動注(zhu)釋數(shu)據(ju)庫Cell ID,注(zhu)釋準確(que)率(lv)高達95%,行(xing)業內遙遙領先,且(qie)正不斷擴增與(yu)更新中。
05、多平臺(tai)兼容
云平臺(tai)分(fen)析支持常(chang)見的單(dan)細胞(bao)轉錄組(zu)數據格式,如(ru)10x Genomics、MGI DNBelab C、墨(mo)卓單(dan)細胞(bao)MobiNova等平臺(tai)。
結 語
派森諾單(dan)細(xi)胞(bao)(bao)云平(ping)臺(tai)的(de)(de)(de)發(fa)布,不僅是技(ji)術的(de)(de)(de)革新,更是對(dui)生命(ming)奧(ao)秘的(de)(de)(de)致敬(jing)。無論(lun)您是初涉(she)單(dan)細(xi)胞(bao)(bao)領域(yu)的(de)(de)(de)研究(jiu)者,還(huan)是需要(yao)加速(su)項目(mu)進(jin)程的(de)(de)(de)資深(shen)團隊,單(dan)細(xi)胞(bao)(bao)云平(ping)臺(tai)都將成為(wei)您探(tan)索(suo)細(xi)胞(bao)(bao)異(yi)質性的(de)(de)(de)得力助手。誠(cheng)邀科研同仁來體(ti)驗!