2025-04-10
單細胞轉錄(lu)組分析可視化系統
針對單細胞(bao)轉錄組數據的復雜性(xing)，構(gou)(gou)建“數據預處(chu)理(li) → 分析(xi)模(mo)塊 → 可視化輸出”全流程解決方案，重點突破細胞(bao)集(ji)構(gou)(gou)建靈活性(xing)、分析(xi)邏輯前置化、高階圖表(biao)可視化三(san)大核(he)心需求。
一、新建細胞(bao)集模塊(kuai)：靈活構(gou)建細胞(bao)數據集
該模塊支持多(duo)元創建(jian)方式，使科(ke)研人(ren)員能夠根據實際(ji)需求，靈(ling)活構建(jian)細胞(bao)數(shu)據集。具體(ti)功能包括：
? 基于細胞質(zhi)控結果創建
? 單個細胞交互(hu)式框選創建
? 多個細胞集(ji)合(he)并創建
? 細胞注釋標簽輕松修改
? 細胞重命名
? 細(xi)胞亞群(qun)與母群(qun)之間(jian)的映射
二(er)、分析(xi)模塊：從分析(xi)到繪圖的(de)一站式(shi)流程(cheng)
該模塊遵循“先分析，基于結果再去繪圖”的原則，提供5大分析內容：
① 創(chuang)建差異分析 ：基于Marker基因(yin)與差異表達分析，揭示細胞群體間(jian)的基因(yin)表達異質性。
② 創(chuang)建(jian)富集分析 ：數據(ju)庫覆蓋GO、KEGG及自定(ding)義(yi)基因集，另外(wai)系統提供自定(ding)義(yi)上傳(chuan)基因列表。
③ 創建(jian)擬(ni)時序分析 ：可(ke)自(zi)由選擇monocle2和(he)monocle3進(jin)行(xing)分析，動態調(diao)整(zheng)參(can)數優化(hua)軌跡拓(tuo)撲結(jie)構。
④ 創建細胞通(tong)訊分析：通過是否組(zu)間(jian)對比來，過濾要參(can)與分(fen)析的細胞。
⑤ 創建基因集打分(fen)分(fen)析：靈活選擇打(da)分(fen)方式(shi)，支持上傳基因(yin)集(ji)打(da)分(fen)的數據進行分(fen)析(xi)。
三、高階可視(shi)化全流程覆蓋：直觀展(zhan)示分(fen)析結果(guo)
云分析系統提供了高階(jie)可視化功能，讓我們(men)能夠直觀地展示分析結果。具體功(gong)能包括：
細胞圖譜(pu)：UMAP / Tsne圖、barplot等細胞(bao)圖譜可(ke)視化；
基(ji)因可視化：氣泡圖(tu)(tu)(tu)、熱圖(tu)(tu)(tu)、基(ji)因(yin)映(ying)射圖(tu)(tu)(tu)、小(xiao)提琴圖(tu)(tu)(tu)等高級(ji)分析圖(tu)(tu)(tu)片可(ke)視化；
功能解析：富(fu)集分析(xi)圖（GO / KEGG / GeneSet ）。
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