2025-05-19
DNA甲基化(DNA Methylation)是表觀遺傳(chuan)修(xiu)(xiu)飾的核心機制(zhi)之一,是指在(zai)DNA分(fen)子(zi)特定(ding)堿基(ji)上添加甲(jia)基(ji)(-CH?)的化(hua)學(xue)修(xiu)(xiu)飾過程。在(zai)哺乳動物中(zhong),甲(jia)基(ji)化(hua)主要發生在(zai)胞嘧(mi)啶(C)的第五(wu)位(wei)(wei)碳原子(zi)上,形成5-甲(jia)基(ji)胞嘧(mi)啶(5mC),且通常發生在(zai)CpG二(er)核苷酸(即胞嘧(mi)啶后接鳥嘌呤的序列(lie))位(wei)(wei)點(dian)。
DNA甲基化是細胞分化、發育調控和疾病發生的關鍵表觀遺傳開關,主要功能包括:基因表達調控、基因組穩定性維護、細胞身份決(jue)定等(deng)。異(yi)常的DNA甲基(ji)(ji)化(hua)(hua)是多種疾(ji)病(bing)的重要(yao)標志,包括神經(jing)退行性(xing)疾(ji)病(bing)、自(zi)身免疫疾(ji)病(bing)、代謝性(xing)疾(ji)病(bing)等(deng),尤(you)其在癌(ai)癥中(zhong)研究最(zui)為深入。目前對DNA甲基(ji)(ji)化(hua)(hua)的研究方法分(fen)為全(quan)(quan)(quan)基(ji)(ji)因(yin)組(zu)(zu)水平和靶向區域分(fen)析。在全(quan)(quan)(quan)基(ji)(ji)因(yin)組(zu)(zu)層(ceng)面,全(quan)(quan)(quan)基(ji)(ji)因(yin)組(zu)(zu)甲基(ji)(ji)化(hua)(hua)測(ce)(ce)序(xu)(Whole Genome Bisulfite Sequencing,WGBS),可將基(ji)(ji)因(yin)組(zu)(zu)DNA中(zhong)未發(fa)生(sheng)甲基(ji)(ji)化(hua)(hua)修飾的胞嘧(mi)啶(ding)C轉化(hua)(hua)為尿嘧(mi)啶(ding)U,通過對處理后的DNA進行全(quan)(quan)(quan)基(ji)(ji)因(yin)組(zu)(zu)測(ce)(ce)序(xu),并與參(can)考基(ji)(ji)因(yin)組(zu)(zu)進行比(bi)對,從基(ji)(ji)因(yin)組(zu)(zu)水平實現單堿(jian)基(ji)(ji)分(fen)辨(bian)率的、高精確度甲基(ji)(ji)化(hua)(hua)水平分(fen)析。 除了WGBS外,全(quan)(quan)(quan)基(ji)(ji)因(yin)組(zu)(zu)層(ceng)面甲基(ji)(ji)化(hua)(hua)檢(jian)測(ce)(ce)技術還有RRBS和甲基(ji)(ji)化(hua)(hua)芯片(pian)。
然而在面對特定(ding)目(mu)標(biao)基(ji)因(yin)或CpG 位點(dian)區域的(de)甲(jia)基(ji)化(hua)檢(jian)(jian)測(ce),全(quan)基(ji)因(yin)組(zu)水(shui)的(de)甲(jia)基(ji)化(hua)檢(jian)(jian)測(ce)成本較(jiao)高(gao)、周期較(jiao)長(chang)、且無(wu)法準確(que)解決(jue)問題,需要(yao)更加靈活的(de)靶向甲(jia)基(ji)化(hua)測(ce)序(xu)方案。 傳統BSP技術針對特定(ding)研究區域設計特異(yi)BSP引物,通過將(jiang)DNA進行(xing)(xing)亞硫酸鹽(yan)處理后使用(yong)BSP引物擴增,然后 對 BSP 產(chan)物進行(xing)(xing) TA 克(ke)隆, 選擇 10-30 個克(ke)隆進行(xing)(xing)測(ce)序(xu),計算甲(jia)基(ji)化(hua)水(shui)平;由于實(shi)驗步驟多,選擇克(ke)隆數量有限(xian),因(yin)此檢(jian)(jian)測(ce)準確(que)性不高(gao),檢(jian)(jian)測(ce)費用(yong)卻很高(gao)。甲(jia)基(ji)化(hua)焦磷(lin)酸測(ce)序(xu)技術可以對 BSP 產(chan)物進行(xing)(xing)直接焦磷(lin)酸測(ce)序(xu),很好(hao)地(di)替代了傳統 BSP,可以檢(jian)(jian)測(ce) 3-5%的(de)甲(jia)基(ji)化(hua)差異(yi),但是由于檢(jian)(jian)測(ce)長(chang)度較(jiao)短,成本較(jiao)高(gao)。
基于亞硫酸鹽多重 PCR 捕獲核心技術和NGS 高深度測序的目標區域甲基化測序Targeted Bisulfite Sequencing(TBS)應運而生。TBS技(ji)術結合了多重 PCR 擴增的高效性和二代高通量測序的準確性,同時又解決了傳統 BSP 和焦磷酸測序按照位點/區域收費的高成本模式,實現了按照樣本收費(與每個樣本檢測位點/區域數無關),TBS技術 滿足幾個到上百個基因/CpG 位點的檢測, 具有高準確性、高通(tong)量、低成本(ben)、快周期(qi)的優勢;廣泛用于臨床樣本(ben)多位點的甲(jia)基化(hua)(hua) Biomarker 篩(shai)選、驗證(zheng)及臨床轉化(hua)(hua)應(ying)用。
TBS技術優勢
針對 感興趣的目標區(qu)域(yu)甲基化檢測(ce),高效靈活
每個位點的平均測序深度大于 200X,可以檢測每個位點1%的(de)甲基化差異
對目標區域的每個 CpG 位(wei)點進行(xing)絕對定(ding)量,具有更(geng)高的準(zhun)確性。
可同(tong)時檢測幾百個(ge)區域/CpG 位點
低成本、快周期,超高(gao)性價比(bi)
實驗(yan)流程
結果展示(shi)
各目(mu)標區域組間(jian)樣本的甲基(ji)化(hua)水平的可視(shi)化(hua)
多(duo)樣本目(mu)標區域(yu)甲基化水(shui)平聚類熱圖
目標區域 CG 甲(jia)基化(hua)水平組間比較
無論您是科研機構探索表觀遺傳機制,還是醫療機構開發臨床診斷方案,TBS技術均能以高性(xing)價比、高靶向(xiang)性(xing)、高可信度的優勢,助您快速突破研究瓶頸,搶占學術與產業先機!立即聯系我(wo)們,獲取(qu)靶(ba)向甲(jia)基(ji)化(hua)定制化(hua)解(jie)決方案(an)與技術(shu)支持,共(gong)同(tong)開啟甲(jia)基(ji)化(hua)研究的精準(zhun)時代!