2025-05-30
派森諾生(sheng)物(wu)自2019年與(yu)10x Genomics 建立深度合作以來，已有6年的(de)單(dan)細胞服(fu)務(wu)經驗(yan)。服(fu)務(wu)內容涵蓋單(dan)細胞與(yu)空間轉錄組測序(xu)全(quan)流程，可提供(gong)從(cong)樣(yang)本處理到文章發表的(de)一站(zhan)式解決方案。樣(yang)本解離能(neng)力卓越，已成功應對(dui)超 100 種物(wu)種、800 多種組織樣(yang)本，特(te)別是在疑(yi)難(nan)樣(yang)本的(de)解離上優勢(shi)盡顯(xian)。
前 言
GEM-X單細胞(bao)解決(jue)方案是基于(yu)Chromium X系列(lie)儀器，對前(qian)版本(ben)Next GEM做(zuo)的全新升級。其(qi)通過微流控芯片架(jia)構與試劑(ji)系統的協(xie)同優化，為單細(xi)胞轉錄組測(ce)序帶來了(le)前(qian)所未有的提升。
GEM-X做了哪些優(you)化(hua)？
1、優化微流控體(ti)系，中位基因值顯著提升
單(dan)細(xi)胞實(shi)驗中，單(dan)個(ge)的(de)細(xi)胞從組織中被解(jie)離下來后(hou)是極(ji)其脆弱的(de)。GEM-X在舊版的(de)基礎上升級為(wei)雙十字(zi)微流控體系(xi)，將運行時間(jian)從18min降(jiang)低至6min，縮短了單(dan)個(ge)細(xi)胞在體外的(de)時長，這極(ji)大程度上減少了細(xi)胞中核(he)酸的(de)降(jiang)解(jie)。
Next GEM微(wei)流控體(ti)系
GEM-X微流(liu)控體系
細胞捕獲動態圖
實(shi)際表現(xian)：
分別(bie)用新版(ban)GEM-X和舊版(ban)Next GEM方案，測試(shi)了(le)PBMC、神(shen)經元細胞(bao)、腦(nao)組織、肺癌組織4種樣本，GEM-X的基因檢出率增(zeng)加(jia)38%-98%。
GEM-X方(fang)案的中位基(ji)因值顯著(zhu)提高
2、試劑優化，細胞捕(bu)獲效(xiao)率(lv)明顯提升
在實驗研究(jiu)中，試劑(ji)猶如 “基(ji)石” 與 “靈魂”，對實驗的成(cheng)敗、數據的可靠性(xing)(xing)起著決(jue)定(ding)性(xing)(xing)作用。本次 10x Genomics 推(tui)出的 GEM-X 單(dan)細胞(bao)解決(jue)方案，圍繞實驗流程(cheng)展(zhan)開革新，對全套試劑(ji)進(jin)行了大幅優化(hua)。
GEM-X全(quan)套試劑盒
實際(ji)表現：
細胞捕(bu)(bu)獲(huo)效率提(ti)升至(zhi)80%。在實(shi)際案例中，用GEM-X和Next GEM分別(bie)測試了(le)小(xiao)鼠腦組織樣(yang)本。Next GEM共捕(bu)(bu)獲(huo)了(le)17527個細胞，GEM-X共捕(bu)(bu)獲(huo)了(le)21332個細胞，細胞捕(bu)(bu)獲(huo)數(shu)提(ti)高了(le)21%。
GEM-X細胞捕獲(huo)數量顯著提升
GEM-X中細胞的Marker基(ji)因豐度明(ming)顯提升(sheng)
3、全新(xin)芯片(pian)，脆弱(ruo)細(xi)胞捕獲率提升
另外，GEM-X還對芯片內部結構(gou)進行(xing)了(le)升級，極大的(de)提高了(le)芯片的(de)通量、靈敏(min)度和靈活性。
實際表現(xian)：
在單細(xi)胞(bao)(bao)研究領域，脆弱細(xi)胞(bao)(bao)因極(ji)易發(fa)生(sheng)凋亡而難以有效(xiao)捕獲。全新芯(xin)片的(de)加持改善(shan)了(le)這一問題。以人白(bai)細(xi)胞(bao)(bao)樣本(ben)為例，作為典(dian)型脆弱細(xi)胞(bao)(bao)的(de)中性(xing)粒細(xi)胞(bao)(bao)，其(qi)捕獲數(shu)量(liang)在 GEM-X 技術(shu)加持下實現了(le)約 3 倍的(de)顯著增長，細(xi)胞(bao)(bao)類型占(zhan)比(bi)也得(de)到(dao)大幅提升。
脆弱細胞類型占(zhan)比顯(xian)著提升(sheng)
派森諾實測數(shu)據展(zhan)示
用GEM-X（V4）和Next GEM（V3）分別測試了(le)人腦(nao)癌組織樣(yang)本。結果顯(xian)示，相(xiang)較于 Next GEM，GEM-X在多項關鍵指標上實(shi)現明(ming)顯(xian)提升：中位基因值大幅(fu)提升，細(xi)胞捕獲數(shu)量顯(xian)著增加(jia)，同時檢測到的基因總(zong)數(shu)也有明(ming)顯(xian)增長。
實測數據表
（其(qi)中V3和V4-測(ce)試(shi)1投(tou)入(ru)(ru)細胞數(shu)均(jun)為1.85萬，V4-測(ce)試(shi)2投(tou)入(ru)(ru)細胞數(shu)為2.9萬）
實測數據對比
實(shi)測(ce)cellranger結(jie)果
V3
V4-測試1
V4-測試2
結 語(yu)
GEM-X 的問(wen)世，重塑了單(dan)細(xi)胞(bao)研究(jiu)的技術標準，無疑(yi)會推動生(sheng)命科學研究(jiu)邁向更高維度。目前(qian)(qian)，派森諾生(sheng)物GEM-X單(dan)細(xi)胞(bao)解決方案(an)已開啟(qi)訂(ding)購(gou)，誠邀廣大(da)科研工作者們(men)前(qian)(qian)來體(ti)驗(yan)。
