2025-06-24
Part 1、什么(me)是DNA甲基(ji)化修飾
甲(jia)(jia)基(ji)(ji)化(hua)修(xiu)飾是指(zhi)在生(sheng)物分子(zi)（如DNA、RNA、蛋(dan)白(bai)質等）的(de)特(te)定(ding)位(wei)點上添加甲(jia)(jia)基(ji)(ji)（-CH?）的(de)化(hua)學(xue)過程(cheng)，由(you)甲(jia)(jia)基(ji)(ji)轉(zhuan)移酶催化(hua)。這(zhe)種修(xiu)飾是表(biao)觀(guan)遺傳調(diao)控(kong)的(de)重(zhong)要機制(zhi)之一，廣泛存在于細菌、古菌和真(zhen)核(he)生(sheng)物中，參與基(ji)(ji)因表(biao)達調(diao)控(kong)、DNA修(xiu)復、宿主-病(bing)原體(ti)互(hu)作等生(sheng)物學(xue)過程(cheng)。DNA甲(jia)(jia)基(ji)(ji)化(hua)位(wei)點，通常(chang)發生(sheng)在堿基(ji)(ji)的(de)特(te)定(ding)位(wei)置，在細菌中常(chang)見于腺(xian)嘌呤（A）的(de)N6位(wei)（N6-methyladenine, 6mA）、胞(bao)嘧啶(ding)（C）的(de)N4位(wei)（N4-methylcytosine, 4mC）或C的(de)5位(wei)（5-methylcytosine, 5mC）。
圖 細菌甲(jia)基化(hua)修飾類型(xing)
Part 2、DNA甲(jia)基化修飾在(zai)細菌(jun)中的作用
防御(yu)機制：細菌通過甲基轉移酶(mei)（甲基化(hua)自(zi)身DNA）和限制性內切酶(mei)（切割未甲基化(hua)的外(wai)源DNA）抵御(yu)噬菌體(ti)感染(ran)
表觀調控：細菌的(de)甲基(ji)化(hua)和基(ji)因(yin)表(biao)達(da)差異具有相關性，表(biao)明細菌甲基(ji)化(hua)在表(biao)觀(guan)調控基(ji)因(yin)表(biao)達(da)方面具有重(zhong)要作用
毒力表現：全基因組的(de)甲基化水平變化會影響細菌菌株的(de)毒力性狀表(biao)現
Part 3、PB直接進(jin)行DNA甲(jia)基化(hua)檢測
基(ji)(ji)(ji)(ji)于(yu)Pacific Biosciences（PB）單分子實(shi)時(shi)測(ce)(ce)序（SMRT）技(ji)術(shu)可以直接(jie)進(jin)行細菌DNA甲基(ji)(ji)(ji)(ji)化(hua)的檢測(ce)(ce)。通(tong)過(guo)實(shi)時(shi)監測(ce)(ce)DNA聚合(he)酶在(zai)合(he)成過(guo)程中(zhong)的動力學特征變(bian)化(hua)，間(jian)接(jie)識別堿(jian)基(ji)(ji)(ji)(ji)修飾（如(ru)5mC、6mA等）。SMRT測(ce)(ce)序中(zhong)，熒光標記的核苷酸摻入新生鏈時(shi)，會產生與(yu)未修飾堿(jian)基(ji)(ji)(ji)(ji)不同(tong)的聚合(he)酶停頓(dun)信號（即脈(mo)沖間(jian)隔與(yu)熒光強度變(bian)化(hua)），通(tong)過(guo)算法解析這些(xie)差異(yi)即可定位甲基(ji)(ji)(ji)(ji)化(hua)位點。
PB直(zhi)接甲基化檢(jian)測流程示意
Part 4、派森諾(nuo)細菌DNA甲基(ji)化分析結果一覽
作為測(ce)序研(yan)究領域的(de)(de)領先企業(ye)，依托PacBio單分子實時測(ce)序技術，派森諾已在細菌(jun)DNA甲基化(hua)測(ce)序領域深耕多年。憑借長(chang)讀長(chang)測(ce)序的(de)(de)優勢，我們能夠(gou)直接(jie)檢測(ce)6mA、4mC、5mC等關鍵甲基化(hua)位點，實現全(quan)基因組(zu)甲基化(hua)圖譜分析。
甲基化位點檢測
甲基化(hua)基序motif檢測
Motif基因注釋
甲基化修飾基因(yin)COG注釋
甲基化位點分布圖
細菌DNA甲基化修飾是指在DNA堿基（如腺嘌呤N6、胞嘧啶N4或C5位）上添加甲基基團的表觀遺傳標記，由甲基轉移酶催化，在限制-修飾系統、基因調控及宿主互作中發揮關鍵作用。PacBio（PB）單分子實時測序技術可直接檢測6mA、4mC、5mC等修飾，憑借長讀長優勢精準解析復雜基因組區域的甲基化模式。派森諾細(xi)菌DNA甲基(ji)(ji)(ji)化檢測服(fu)務(wu)，為您(nin)提供全基(ji)(ji)(ji)因組覆蓋的甲基(ji)(ji)(ji)化圖譜，結(jie)合專業生信(xin)分析，可(ke)精準關聯(lian)甲基(ji)(ji)(ji)化信(xin)號區域，助力(li)您(nin)在甲基(ji)(ji)(ji)化研究領域更上一(yi)層樓。
