2025-06-26
自引進 Thermo Scientific Orbitrap? Astral? 高分辨質(zhi)譜儀以來,派森諾生物蛋白(bai)代謝事業部圍繞深度蛋白(bai)組學積極開展(zhan)項目合(he)作與應用探索。通過(guo)優(you)化前處(chu)理流程、升級 DIA 方法并建立(li)完善質(zhi)控體系,Astral DIA 平(ping)臺在多種樣本中展(zhan)現出(chu)優(you)異性(xing)能。
為直觀呈現真實項目(mu)效果(guo),我們(men)從2025年(nian)已運行項目(mu)中隨機(ji)篩(shai)選150個(ge)(ge)項目(mu),涵蓋常規、高深度(du)、血(xue)液、宏蛋白(bai)組及(ji)微量(liang)蛋白(bai)組等多個(ge)(ge)方向,涉及(ji)80余種樣(yang)本類型,系統展示了Astral平臺的(de)蛋白(bai)識別能力。
常(chang)規蛋白組(zu):180 SPD 實力穩定,植物組(zu)織表現突出
在最具性價比的 180 SPD Astral DIA 檢測方案中,我們按樣本來源將150個項目分為動物組織、動物細胞、人源(yuan)細胞、組織與(yu)植物組織五大類。各類型樣本中根據不同項目蛋白鑒定的最大值、最小值及平均值統計顯示:Astral DIA 平臺在常規條件下可穩定實現 8500+ 的(de)蛋白(bai)檢出(chu)量,其(qi)中(zhong)植物(wu)組織(zhi)的(de)識別(bie)深度普遍優(you)于(yu)其(qi)他(ta)樣本類型(xing),表現出(chu)更(geng)強的(de)通量支持(chi)能力。
不同(tong)樣品類型180 SPD Astral DIA蛋白(bai)鑒定(ding)情況(kuang)
高深度蛋白組:60 SPD/48 SPD 助力(li)蛋白鑒定突破(po) 11000+
采用更高深度的 DIA 方法(如 60 SPD 或 48 SPD)可顯著提升蛋白識別數量,在實際項目中,多個項目可達到 12000–13000 蛋白的實測水平,是復(fu)雜系(xi)統生(sheng)物學(xue)研究(jiu)的有力工具。
派(pai)森諾Astral DIA高深度蛋(dan)(dan)白組蛋(dan)(dan)白鑒定情況(kuang)
宏蛋白組:樣(yang)本多(duo)樣(yang)性大,Astral DIA 提升整體識別能(neng)力
宏(hong)蛋白組在醫(yi)學、農業、微生態和(he)環境研究中具有廣(guang)泛(fan)需求,但由于(yu)涉及多物種混合、數(shu)據庫不(bu)完(wan)善、樣(yang)(yang)品處理復(fu)(fu)雜(za)(za),長期被視為質(zhi)譜分析的(de)挑戰領域。得益于(yu) Astral 平臺的(de)高通量(liang)與高靈敏(min)度(du),派(pai)森諾(nuo)已在多個宏(hong)蛋白組項(xiang)目(mu)中取得重要進展。實測數(shu)據顯示,不(bu)同項(xiang)目(mu)蛋白鑒定量(liang)存在一定差異,范圍(wei)從幾千(qian)到(dao)上萬不(bu)等,反(fan)映出(chu)不(bu)同樣(yang)(yang)本(ben)復(fu)(fu)雜(za)(za)度(du)對數(shu)據表現的(de)直接影響。
宏(hong)蛋(dan)白組蛋(dan)白鑒(jian)定情況
血液蛋白組:從難題(ti)到突(tu)破,磁珠富(fu)集 + Astral 實現深度(du)躍遷
血液樣本中高豐度蛋白的(de)干擾曾是蛋白組檢測的(de)一(yi)大障礙。結合(he)磁珠富集技術與(yu)Astral DIA平臺,派森諾在人類、大小鼠(shu)等來源(yuan)的(de)血清(qing)、血漿項(xiang)目中均實現了(le)顯著提(ti)升的(de)蛋白覆蓋度,為(wei)臨床研究和疾病(bing)標志物開發提(ti)供了(le)強有(you)力的(de)支(zhi)持。
血液(ye)蛋白(bai)組蛋白(bai)鑒定情況
微(wei)量(liang)蛋白(bai)組:挑戰臨床瓶頸,FFPE/穿刺樣本照樣深挖
臨(lin)床研(yan)究(jiu)(jiu)中常常面(mian)臨(lin)樣(yang)本量(liang)極小的(de)難(nan)題,如FFPE切片、穿刺(ci)組(zu)織(zhi)、微(wei)量(liang)細胞群體等。傳(chuan)統方(fang)法難(nan)以有效檢測(ce)(ce),但在(zai) Astral DIA 支持下,派森諾對 1–2 張 FFPE 切片、亞(ya)毫克級組(zu)織(zhi)樣(yang)本的(de)檢測(ce)(ce)中依(yi)然可(ke)實現上萬蛋白的(de)定量(liang)識別,顯著拓展了微(wei)量(liang)樣(yang)品(pin)在(zai)組(zu)學研(yan)究(jiu)(jiu)中的(de)可(ke)行性。
微(wei)量蛋(dan)白組蛋(dan)白鑒定情況
結(jie)語:數據(ju)見實力(li),合作贏未來
通過(guo)真實(shi)(shi)項目(mu)的(de)系(xi)統分析,派(pai)森諾 Astral DIA 蛋(dan)(dan)白(bai)(bai)(bai)組平臺已在多個(ge)應用方(fang)向(xiang)展現出優(you)異(yi)(yi)的(de)實(shi)(shi)測深度、穩定(ding)性與(yu)樣本適應性。需要特別(bie)指出的(de)是(shi),不(bu)同(tong)樣本類型(xing)因(yin)組織(zhi)復(fu)雜度、前處理方(fang)式及基因(yin)背景(jing)差異(yi)(yi),蛋(dan)(dan)白(bai)(bai)(bai)識別(bie)能力可(ke)能存在波動,若您(nin)對(dui)某一具體類型(xing)樣本的(de)項目(mu)數據(ju)感(gan)興趣,歡(huan)迎聯系(xi)派(pai)森諾生物銷售(shou)工(gong)程(cheng)師獲取詳盡的(de)技(ji)術(shu)資料(liao)與(yu)合作方(fang)案!值得一提的(de)是(shi),除了常規蛋(dan)(dan)白(bai)(bai)(bai)組,Astral平臺在修飾蛋(dan)(dan)白(bai)(bai)(bai)組領(ling)域表現毫不(bu)遜色,期待下一期的(de)實(shi)(shi)例分享。