2025-06-30
Highlights
1、免疫沉淀(IP)及(ji)其衍生技(ji)術 Co-IP、ChIP、RIP,如(ru)同 “分子捕手”,精(jing)準捕獲蛋白、蛋白互作(zuo)、蛋白 - DNA/RNA 互作(zuo)。
2、四大技(ji)術各有專攻:IP 專注單(dan)一蛋白(bai)純化,Co-IP 揭示蛋白(bai) “社交圈(quan)”,ChIP 定位(wei)基因(yin)調控 “開關(guan)”,RIP 追蹤 RNA “守護者”。
3、從(cong)原理到應用場(chang)景全面對比,助(zhu)你選對實驗工具,派(pai)森諾提供試劑耗材支持,護航科(ke)研之(zhi)路!
在(zai)細胞(bao)這個精密運轉(zhuan)的(de)(de)“微型宇宙(zhou)”中(zhong),蛋(dan)白質、核酸等生(sheng)物大分(fen)子(zi)時刻(ke)進(jin)行著復雜而有序的(de)(de)互(hu)動(dong),猶如一場永不(bu)落幕的(de)(de)分(fen)子(zi)社交舞會。如何捕捉這些(xie)稍縱(zong)即(ji)逝(shi)的(de)(de)關(guan)鍵互(hu)動(dong)?免疫沉淀(IP)及其衍生(sheng)技術——Co-IP、ChIP和RIP,正是科(ke)學(xue)家們(men)手中(zhong)強大的(de)(de)“分(fen)子(zi)捕手”,助力我(wo)們(men)揭示生(sheng)命活動(dong)的(de)(de)核心機制(zhi)。
一(yi)、IP實驗:精準捕獲的“單兵作戰”
核心原理: 利用抗原(yuan)(yuan)-抗體(ti)結(jie)合的(de)高度特(te)異(yi)性。將針對(dui)特(te)定目(mu)標蛋(dan)白(抗原(yuan)(yuan))的(de)特(te)異(yi)性抗體(ti)固(gu)定在(zai)固(gu)相(xiang)載體(ti)(如磁(ci)珠)上,當(dang)與(yu)細胞(bao)裂解(jie)液(ye)(ye)混合時,抗體(ti)便能像磁(ci)鐵(tie)一樣“抓(zhua)住”溶(rong)液(ye)(ye)中的(de)目(mu)標蛋(dan)白,形成免疫復合物。通(tong)過洗滌去(qu)除雜(za)質(zhi),最終獲得高度純化(hua)的(de)目(mu)標蛋(dan)白。
二、Co-IP實(shi)驗(yan):挖掘(jue)互(hu)作伙伴的(de)“社交(jiao)網絡(luo)”
核(he)心(xin)原理: 在(zai)(zai)IP的基礎上(shang)更進一(yi)步。利用(yong)抗體捕獲“誘(you)餌(er)”蛋(dan)(dan)(dan)白(Bait Protein)時,與“誘(you)餌(er)”蛋(dan)(dan)(dan)白在(zai)(zai)生理(li)條(tiao)件下穩定結合的“獵物(wu)”蛋(dan)(dan)(dan)白(Prey Protein)也會(hui)被一(yi)同“釣”下來,形(xing)成復合物(wu)。通過特異(yi)性檢測(如Western Blot)復合物(wu)中的組(zu)分,即可(ke)確定與誘(you)餌(er)蛋(dan)(dan)(dan)白相互作用(yong)的伙伴。
三(san)、ChIP實驗:定位基(ji)因調控的“時空密碼(ma)”
核心(xin)原理: 將(jiang)IP技術與DNA分析相(xiang)結(jie)(jie)合(he)(he),用(yong)于(yu)研究蛋白(bai)質與DNA的(de)相(xiang)互作用(yong)。首先用(yong)甲醛等交聯劑(ji)將(jiang)細胞內與DNA結(jie)(jie)合(he)(he)的(de)蛋白(bai)質“固定”在(zai)其結(jie)(jie)合(he)(he)位點上。裂(lie)解(jie)細胞并將(jiang)DNA打(da)斷成片段(duan)。用(yong)針對目(mu)標蛋白(bai)(如轉(zhuan)錄因子、組蛋白(bai)修飾(shi))的(de)抗體進行免疫沉(chen)淀。此時,與目(mu)標蛋白(bai)結(jie)(jie)合(he)(he)的(de)DNA片段(duan)也(ye)會被(bei)共沉(chen)淀下來(lai)。解(jie)除交聯并純化(hua)DNA后,即可通(tong)過PCR、qPCR或高(gao)通(tong)量測序(xu)(ChIP-Seq)確定目(mu)標蛋白(bai)在(zai)基(ji)因組上的(de)精確結(jie)(jie)合(he)(he)位點。
四、RIP實驗:追蹤RNA命運的(de)“信使捕捉”
核心原理(li): 與ChIP類似,但(dan)研究(jiu)對象是(shi)蛋白(bai)質與RNA的相互作用。無需甲醛交聯(lian)(或(huo)(huo)使用溫和交聯(lian)),利(li)用抗(kang)體沉淀(dian)目標RNA結(jie)合蛋白(bai)(RBP)。在沉淀(dian)過程中(zhong),與該RBP穩定(ding)(ding)結(jie)合的RNA分子(mRNA, lncRNA, miRNA等(deng))也會被一同富集下(xia)來。純化RNA后,可通過RT-qPCR、芯片雜交或(huo)(huo)高通量測序(xu)(RIP-Seq / CLIP-Seq)鑒定(ding)(ding)出哪些RNA是(shi)目標RBP的“客戶”。
五、四大“IP”技(ji)術對比一覽表
四大“IP”技(ji)術,雖(sui)共享“免疫沉淀(dian)”這一核心思想,卻因檢測目(mu)標(蛋白(bai)、互作蛋白(bai)、DNA、RNA)的不同(tong)而各顯(xian)神通:
IP是基石,專(zhuan)注于單(dan)一目標的(de)捕獲。
Co-IP拓展疆(jiang)域,揭示(shi)蛋白質間的“社交圈(quan)”。
ChIP深(shen)入核心,定(ding)位調控基(ji)因表達的“開(kai)關”。
RIP解碼信息,追蹤RNA生(sheng)命(ming)周期的(de)“守護者”。
六(liu)、小 結
IP、Co-IP、ChIP、RIP這(zhe)四種基于(yu)免疫沉(chen)淀的(de)強大技術,為科(ke)研人員提供了從(cong)蛋(dan)白質鑒(jian)定、互(hu)(hu)作研究到基因轉錄調控、RNA代謝解(jie)析(xi)的(de)全方位(wei)(wei)解(jie)決方案。理(li)解(jie)它們的(de)原理(li)、目標和(he)應用場景,根據科(ke)學問題選擇最趁(chen)手的(de)工具,輔以嚴謹的(de)實驗(yan)設計和(he)操作,助您在科(ke)研征(zheng)途上收(shou)獲豐碩成(cheng)果(guo)!派森諾竭誠為大家提供蛋(dan)白互(hu)(hu)作研究實驗(yan)過程(cheng)中所涉(she)及的(de)試(shi)劑耗(hao)材,助力每一(yi)位(wei)(wei)生命科(ke)學實驗(yan)室的(de)科(ke)研人收(shou)獲屬于(yu)自己(ji)的(de)完美實驗(yan)結果(guo),逐夢高分(fen)文章~