2016-10-28
研究(jiu)背景
自(zi)閉癥,又稱孤(gu)獨癥,主(zhu)要(yao)特征是漠視情感、拒絕交流、語言(yan)發育(yu)遲滯、行為重(zhong)復刻板(ban)以及活動興趣范(fan)圍的顯著局限性,一(yi)般在3歲(sui)以前就會表現出來。其發病原因有多種,已確(que)定遺傳因素(su)對(dui)自(zi)閉癥作用明(ming)確(que),但具(ju)體因素(su)尚不(bu)明(ming)確(que)。
研究結果
新生突變(de novo mutations, DNMs)是導致自閉癥的重要因素,此前對自閉癥新生突變的研究中,只對編碼區的1.5%基因進行過測序。研究者選取了200對父母和孩子的種系樣品,通過Hiseq平臺對樣品進行了全基因組的重測序。結果發現大部分種系DNMs(75.6%)來自父親,且隨著父親年齡增加而增加。然而,大部分簇的DNMs來自于母親,且與新生CNVs突變相鄰。同時,檢測到大量(liang)有破(po)壞性的(de)突變(bian)存在于非(fei)編(bian)碼(ma)區(qu)(qu)(15.6%)和遺傳非(fei)編(bian)碼(ma)區(qu)(qu)(22.5%),雖(sui)然這些非(fei)編(bian)碼(ma)區(qu)(qu)的(de)突變(bian)基因不會被翻(fan)譯,但是他(ta)們(men)參與調控外顯子(zi)跳躍或(huo)者處于脫氧核糖(tang)酶I的(de)高敏感區(qu)(qu)域。
對發(fa)生DNMs突變類型進行統計,具(ju)體結果(guo)見圖1。
圖1:DNMs突變類型(xing)
對樣品的家系、簇族和體(ti)細胞(bao)的突(tu)變進行(xing)檢測(ce),分析突(tu)變來源,具體(ti)結(jie)果(guo)見圖2。
圖(tu)2:自閉癥突變來源檢測(ce)
同(tong)時,通(tong)過重(zhong)測序(xu)對樣品中(zhong)破壞性的(de)突變(bian)進(jin)行檢(jian)測,同(tong)時驗證這些突變(bian)對功能的(de)影響,具體結果見圖3。
圖3:破壞性突變對功能的影響
結論
研(yan)究者通過對(dui)200個家庭共600人進(jin)行(xing)了(le)全基(ji)因組(zu)的重測序,對(dui)自(zi)閉(bi)癥(zheng)進(jin)行(xing)了(le)研(yan)究,為自(zi)閉(bi)癥(zheng)提供了(le)各(ge)種類(lei)型基(ji)因突變類(lei)型的閾(yu)值模型,對(dui)自(zi)閉(bi)癥(zheng)的遺傳因素有更新的認知。
參考文獻
Yuen, RK, et al. Genome-wide characteristics of de novo mutations in autism. NPJ genomic medicine, 1, 16027-1.